日前出版的世大運手冊裡，將獨派團體貼上恐怖分子的標籤，引來台灣國辦公室主任陳峻涵不滿，4日下午至市政府前抗議，台北市長柯文哲表示，手冊通常都是由國際英文版翻譯成中文，他要確認一下是不是翻譯過程中出了問題，造成誤譯。
柯文哲4日下午出席國際護師節活動後受訪，針對為何手冊將獨派影射為恐怖份子的疑問，柯文哲坦言「我也不曉得」表示手冊應該是英翻中，這段文字到底是從何處翻譯過來，必須再做確認，並承諾會詢問執行長蘇麗瓊。
手冊中也指出，世大運素有小奧會之稱，每個國家的會期將由國旗做代表，而我國的代表則是奧會的會旗，在國人不瞭解奧會模式的情形下，易讓本土或獨派意識濃厚人士，以「國旗」問題藉機製造事端。
對於國旗是否能進入世大運的比賽會場，柯文哲承認這件事情比較棘手，他指出當初在FISU國際體總要求下的確有簽同意書，願意讓世大運比照奧會模式進行，如果有不同的意見，近日FISU國際體總總會會長會來台灣，將會在跟FISU再做討論。
柯文哲說明，當初是當時的市長郝龍斌在申請承辦，在他當選後，FISU有要求他要簽署一紙同意書，當時他也有簽字。柯文哲指出，既然大家有不同的聲音，自然會再做討論，了解所謂奧會模式怎麼執行，再商討出最佳的辦法。
