台灣獨立建國聯盟15日舉行「2017蔡英文政府執政周年檢討與展望」座談會，由於總統蔡英文選前承諾將積極推行「轉型正義」，政治大學台灣史研究所教授薛化元針對「政治檔案」的定義，及12年國教總綱提出質疑。
針對政治檔案的界定，據了解，現行主要是根據《促進轉型正義條例草案》、《戒嚴時期不當叛亂暨匪諜案件補償條例》來判定，二二八事件中觸及的內亂、外患罪嫌、《懲治叛亂條例》、《戡亂時期檢肅匪諜條例》等涉及的案件皆稱為政治檔案。
薛化元表示，這些政治案件雖在時間軸的劃設上沒有問題，但在定義上仍有斟酌空間。薛化元指出，除了部分政治案件經由專業委員會認定後能彌補原先內容的缺漏，但對於慘遭「密裁」等不為人知的政治事件，該如何納入轉型正義來處理？
此外，原先《戒嚴法》指出，戒嚴時期受到軍事審判的平民可依法向司法機關提起上訴，然而其中受到軍法制裁的案件中有許多未涉及二二八事件中的內亂、外患罪嫌、《懲治叛亂條例》、《戡亂時期檢肅匪諜條例》，意即目前行政機關定義的政治檔案範疇比原先的《戒嚴法》範圍還小。
薛化元也以「美麗島事件」為例，他指出，除了受到軍法審判的8名重要領導人，其餘數十位與事者都不是根據上述法令起訴審判。也就是說，他們的案件需再經由專業委員會進一步認定是否為政治檔案或轉型正義的範疇。
另對於12年國教總綱內容，薛化元表示，教育部竟將「社會科」從原先授課的24小時，刪修為18小時，而且還要再細分公民、歷史、地理三科；語文科目則相反，「國語文」及「中華文化基本教材」至少須24學分，「英語文」及「第二外語」也至少24學分，兩者加起來共48個學分，就占了2分之1。薛化元質疑，真的需要這麼多文言文嗎？
