前瞻基礎建設預算高達8800億元，軌道建設更是重要項目，行政院長林全日前表示「只有2項涉及區段徵收」，但卻被媒體爆出交通部官網列出38項軌道建設報告書中18項涉及「區段徵收」。時代力量立院黨團助理陳為廷也質疑，「一個連閣揆自己都搞不清楚的計畫，你們到底在強推什麼？」交通部今（3）日澄清，林全只有2個已核定計畫採區段徵收的說法是正確的，其餘報告僅是分析徵收或協議購價、撥用等優缺點，並非確定採區段徵收。
交通部表示，前瞻軌道基礎建設專區上公布的是38項軌道計畫「階段性」報告，並非最後核定通過的計畫，一旦確定審議通過，交通部都會隨時更新上網公開。有些報告會分析土地取得採用一般徵收、協議購價、撥用、區段徵收等方式優缺點，所以提到區段徵收的資訊，並非確定採區段徵收。為避免誤解，交通部已更新前瞻軌道專區內容，也在專區問答集中解釋清楚。
交通部說明，已再次與各縣市政府部一起盤點38項軌道建設計畫，有採「區段徵收」只有1項，就是105年4月20日核定的桃園捷運綠線，因為部分場站屬航空城計畫或南崁新市鎮都市計劃區內，先前整體都市計劃即是採區段徵收，並非因前瞻基礎建設計畫而採用。另102年2月25日核定的淡海輕軌現採一般徵收，但當地的居民反而要求保留未來5年內能參與「淡海新市鎮第二期」區段徵收的權利。林全所提的前瞻軌道基礎建設「只有2個已核定計畫採區段徵收」說法，交通部表示是正確的。
