在總統府、行政院、台灣日本關係協會會長邱義仁積極推動下，將開放牛肉議題，成功換取日本同意大量開放我金鑽鳳梨、蜜棗、柑橘等農產品輸出；同時雙方近期開始推動包括製造、服務、電子、機器人等企業，洽談如何攜手，共同開拓新南向國家市場。
ＥＰＡ、ＴＰＰ，成關係升級目標
除了合作開拓新南向市場外，行政院表示，另一個多重戰略考量，即在於台日農產品相互開放，可以做為重啟《台日經濟夥伴協定》（ＥＰＡ），以及以堆積木的方式累積善意，爭取加入現在由日本所主導的《跨太平洋夥伴協定》（ＴＰＰ），讓雙邊友好關係，再次大幅升級。
不過，有關農產品開放，接下來還有兩項重大挑戰，首先是對於美國牛肉進一步開放，以及是否開放含萊克多巴胺（瘦肉精）的美豬；其次是日本核災區食品進口問題，台灣設限被視為貿易障礙，後續談判將挑動彼此利益衝突與敏感神經。
台灣加速對日經貿整合，也有助進入美國與東南亞市場，前民進黨中國事務部主任顏建發對此投書媒體指出，日本與歐盟已經完成《日歐經濟夥伴關係協定》（ＥＰＡ），在年底即將簽署，「這是利潤極高的通道」。至於開放核災區食品議題，他則認為，全世界只剩中國、韓國、台灣一再延宕食安處理，「沒有道理」。
由於先前日本核食解禁議題，最後演變為朝野與社會嚴重對立失控情形，這次行政院食品安全辦公室（以下簡稱食安辦），在開放日本牛肉前相當緊張，提前近兩個月，開始與台灣肉牛產業發展協會、主婦聯盟、董氏基金會等產業與非政府組織（ＮＧＯ）團體進行溝通，初步反應良好，讓行政部門鬆了一大口氣，也化解一部分日方對我未能開放核食的不滿。
對於畜牧業主要擔心的問題，食安辦主任許輔表示，主要是擔憂有人會以日本次級混種的肉牛，以「來自日本的和牛」為名，行低價搶市惡性競爭，就會打壓到台灣牛肉的市場；而消費團體則關心是否依據程序，掌握國外最新狂牛症預警資訊，以及標識與稽查等食安把關問題。
開拓新南向金礦，台日企業合作
政府在開放牛肉進口前，都有派出專人前往當地查驗，牧場是否採用專用飼料而非榖粉，以及屠宰場是否依規定程序進行作業；未來開放也必須是來自於經過認證的屠宰場才能進口，也會要求落實查驗工作，讓消費者安心。同時密切觀察市場變化，必要時會比照日本強制標明，為真正的「和牛」設計專屬標識。
「近期台日關係發展與交往，進步非常大。」行政院經貿談判辦公室總談判代表鄧振中肯定台日農產品相互開放，對於促進雙邊關係，包括ＥＰＡ、ＴＰＰ，都會有正面的助益，「可以慢慢培養彼此善意」。特別是結合我方人脈廣、彈性大，日本品質好、品牌力等雙方優點，雙方不少企業已經開始洽談，要共同開發龐大的新南向市場商機。
至於美豬、美牛部分，相較之下顯得相當尷尬，美國貿易代表署公布外國貿易障礙評估報告，曾點名台灣應該全面開放。近期美國在台協會（ＡＩＴ）理事主席莫健（James Moriarty）、美台商業協會會長韓儒伯（Rupert Hammond-Chambers）在不同場合多次強調，美豬、美牛開放「台灣應該維持承諾」，並且暗示為新一輪的軍售案條件之一。台美近期將舉行貿易對話，乃至是否復談的台美貿易暨投資架構協定（ＴＩＦＡ）會議，都將觸及此一議題。
針對美國強力叩關，行政院還沒有啟動開放評估作業，並且設下「安全疑慮未解，再大壓力也不會開放」的前提。鄧振中坦言：「美方壓力一直都在，除非問題獲得解決。」關鍵在於國人與產業還不放心，雖然很困難，仍要一步一步化解疑慮，在提升整體食安制度讓大家安心之前，「暫時不會處理」、「（美方）再大壓力也沒辦法」。據瞭解，長期以來，台美雙方對此不斷進行溝通，芭樂開放、文心蘭放寬檢疫，被規畫為優先爭取美方放行的農產品。
