1947年3月，阿姆利則市要求該市加入巴基斯坦的穆斯林和要求該市加入印度的印度和錫克教徒發生嚴重的暴力衝突，城市很多地方淪為斷垣殘壁。（BBC中文網）
人間煉獄
分治宣佈前後，特別是在旁遮普等地爆發不同種族宗教人士之間的瘋狂攻擊和大屠殺，難以計數包括老人、婦女、兒童在內的人民被殺戮、綁架、強姦、攻擊，無數的房屋財產被焚毀。人們紛紛逃往和自己宗教信仰相同的地區。目擊者稱，一些載滿難民的火車半路被截停，等火車抵達目的地，車上除司機外已經沒有生存者。
大約1450萬人逃過突然宣佈的國界，成為是人類歷史上最大規模之一的難民遷移。這些難民很多聚集到大都市附近，形成巨大的貧民窟，繼續給2國各自造成嚴重社會隱患。在此之後的10年裏，這些難民中多數才逐漸得到安置。
匆忙分治造成的地緣政治、文化、宗教、種族的深刻鴻溝並未得到修補，相反在後來的70歷史中持續存在下來，並不斷釋放動蕩的力量。2國首都雖然相距並不遠，但即使到今天，新德里和伊斯蘭瑪巴德之間也沒有直達的航班飛機。
自由的代價
時至今日，印巴在克什米爾停火線附近仍時有武裝衝突。圖為印軍士兵。（BBC中文網）
印巴分治讓主張分治的人士和團體認為獲得自由和解放，但慘痛的經歷給印度和巴基斯坦2國人民帶來無法忘卻的慘痛回憶，仇恨的種子在無數人心中撒下，鋪墊了之後70年裏的新仇舊恨。
印巴分治並未解決新獨立的兩個國家間的邊境和領土爭議，目前兩國最大的爭議在於接壤中國的克什米爾地區。在後來70年裏，印度和巴基斯坦兩國間爆發3次大戰，以及時緩時急、持續至今的小規模衝突。
1947年，由在次大陸獨立運動中一直在政治、經濟、人口等方面地位相對較弱的穆斯林組成的巴基斯坦，分治的災難遠未結束：巴基斯坦被分為在印度西邊的西巴基斯坦（現巴基斯坦）和在印度東邊的東巴基斯坦（現孟加拉）。
1947年分治時流亡到東巴基斯坦的比哈爾穆斯林和孟加拉穆斯林之間的種族、語言、文化差異在政治經濟矛盾下1971年演變成不可調和的衝突，在印度軍隊擊敗巴基斯坦軍隊的戰爭支持下，孟加拉國成立，巴基斯坦被分裂為兩國。這次分裂又伴隨著一次不同種族、宗教派別群眾之間殘忍的大規模攻擊和仇殺。
中國無暇南顧和西藏問題
正當1947年印巴分治、次大陸一片混亂之際，中國也陷入二戰結束後逐漸開始的國共大規模內戰，中央政府無暇南顧。但中國和南亞的歷史文化聯繫卻無法割斷，特別是對南亞的文化、語言等有千絲萬縷聯繫、和南亞多國直接接壤的西藏地區。
