2009年7月5日，維人與政府關係出現新的分水嶺，起因是一起工廠衝突，幾名維人員工與漢人鬥毆後死亡，維人在烏魯木齊和平抗議卻遭警方強力鎮壓，官媒報導至少197人喪生。當地網路被切斷近10個月，大批維吾爾青年失蹤，至今仍有數百名下落不明。
習近平2012年執掌中共後，維人宗教活動的空間越發限縮，中共把地方限制措施法制化，如2015年2月《烏魯木齊市公共場所禁止穿戴蒙面罩袍規定》以及2016年1月《國家反恐法》等。理論上，法制化是一種保障，但這些法律沒有嚴格定義「恐怖主義」、「宗教極端主義」等詞彙，以至於地方官員為免漏網，多有擴大解讀、從嚴控管。
報告指出，維吾爾穆斯林的生活受巨幅影響，除了婦女配戴頭巾或罩袍易受刁難，每年一次的齋戒月中，政府也強制要求餐廳不得歇業，學生、公務員被強迫要求進食，政府還要求維人參加跳舞或各種官方團康活動，雇主若不敦促員工參加活動，自己就要被迫參加更久。
維人婦女過去不習慣上清真寺，習慣在家裡禮拜、聚會，這類聚會目前也遭到禁止，宗教節日或婚喪喜慶等公開儀式也面臨更嚴格的取締。2015年開始，政府還規定「未成年人不得參與宗教活動」，2017年8月，新疆和田教育局明文禁止各級學校使用維吾爾語，規定3年內達到全面使用中文的目標。
只用來限制維吾爾穆斯林的手段還包括：清真寺被要求懸掛中國國旗、店家被強迫出售酒品、年輕人因瀏覽與伊斯蘭教有關的網路影片被捕（影片還是由回族穆斯林製作的），在校大學生被禁止參加宗教活動，維吾爾族穆斯林不被發予簽證、無法參加朝覲等等，公共場所也大幅增加嚴密的監視系統、搜身行動和逮捕事件，警方經常被控過度使用致命性武力。
暴力循環 反伊斯蘭情緒恐滋長
無孔不入的控制已經造成維吾兒族人民嚴重反彈，也引發恐怖攻擊事件。如2014年3月昆明火車站暴力事件，8名維吾爾人闖入火車站隨機砍人，造成31人死亡、141人受傷；2014年4月烏魯木齊火車站爆炸攻擊，含攻擊者在內3人死亡，79人受傷。這些暴力事件引發漢族為主的大眾恐懼，政府更有藉口加強對新疆地區的掌控，報告指出，維吾爾人無論涉及何種罪名，被捕入監後很有可能被毆打虐待，特別針對那些信仰堅貞的犯人。
《中國靈魂爭奪戰》表示，目前毫無跡象顯示，習近平與中共政府會改變對穆斯林的政策走向。反之，2016年開始的一系列政策，如前西藏書記調任新疆等等，只顯示中共政府將加強控制手段。中國7月正式展開的「一帶一路」經濟計畫，涉及400億美元的建設，新疆則是必經之路，「維穩」的需求只增不減。
報告認為，如果中國當局繼續將「恐怖主義的暴力行動」與「和平宗教活動」混為一談，只會讓新疆情勢和暴力循環繼續惡化下去，社會大眾反穆斯林、反伊斯蘭的情緒也會滋長，恐怕無法避免影響到回族和其他民族穆斯林的宗教自由權利。
