瓊斯原本應該在今年10月假釋出獄，但因為她申請上博士班，獄方為了讓她趕上開學，特別減免2個月的刑期。她的第一志願是哈佛大學（Harvard University），因為她仰慕研究監獄史的哈佛大學歷史學家。
質疑「未全盤交代過往」 哈佛拒收瓊斯
儘管瓊斯在300位哈佛歷史研究博士班申請者中脫穎而出，成為18位錄取者之一，但哈佛2位教授向高層提交備忘錄之後，校方高層卻罕見不讓系所自主決定錄取者，並否決了瓊斯的申請。向高層提交備忘錄的美國研究教授斯托夫（John Stauffer）稱：「我們並非先入為主地迫害蜜雪兒（瓊斯），但我們都可以從Google查到她的犯罪資料，福斯新聞（Fox News）還可能會說，一向政治正確的哈佛，對剛好是少數族裔的孩童殺手，提供20萬美元（約新台幣605萬元）的研究經費。」
哈佛大學美國研究的教授上呈給哈佛主管的備忘錄質疑，瓊斯並沒有詳細交代她犯罪的過往，只提到她對布蘭登死去的悔恨，備忘錄寫道：「誠實與全盤敘述在我們這行來說很重要。」這份備忘錄也質疑瓊斯對過去的敘述是否達到了標準。
支持瓊斯進入哈佛讀書的哈佛歷史學者辛頓（Elizabeth Hinton）則說：「瓊斯是美國去年實力極為堅強的申請人」，還指出這項申請案的結果讓人反思，「我們真的相信人們有贖罪的機會嗎？」
當年起訴瓊斯的檢察官摩爾（Marger Moore）也支持瓊斯有進入哈佛讀書的機會，她說：「就一個母親來說，我認為她犯了很嚴重的罪行。但哈佛所做的相當不恰當：我才是檢察官，他們不是。」
美媒力挺瓊斯 網友反應兩極
瓊斯的申請被哈佛否決的報導曝光後，美國多家媒體聲援瓊斯，認為她有權進入哈佛讀書。《時代》雜誌（Time）指出，美國社會應該原諒瓊斯，「很大的原因是持續為了青少年時期犯下的過錯處罰瓊斯，無助於她死去的孩子，不會讓他的生命更珍貴，也不會幫助到未來的受虐兒。瓊斯的案例點燃了美國最尖銳的問題：我們如何改善監獄？我們如何打破世代進入監獄的困境？我們要怎麼幫助那些易受傷害的兒童與母親？」《時代》雜誌認為，瓊斯可以從獨特的視角協助專家改善並解決這些問題，但社會若不給她機會，她就很難改過自新，貢獻社會。
《紐約客》雜誌（New Yorker）也指出，大學不再是研究的避風港，而是應該維護公眾利益的機構，「大學應該樂於收取那些對迥然不同、具衝突性的過去和解的學生。」哈佛不讓瓊斯就讀，逃避了定義21世紀大學的機會。
然而推特上網友對於瓊斯的遭遇反應兩極，網友葛雷（Cameron Gray）指出瓊斯就是一位「孩童殺手」，「為什麼左派持續把這些殺手當成英雄？」
Michelle Jones: Child killer
— Cameron Gray (@Cameron_Gray) 2017年9月18日
Assata Shakur: Cop killer
Ramsea Odeh: Jew killer
Why do leftists continue to make heroes out of killers? https://t.co/4Enurtt1ce
但在哈佛就讀的博士生史密斯（Clint Smith）則支持瓊斯在哈佛就學，指出「哈佛決定駁回瓊斯的申請，顯示一些人士只在理論的領域中支持平等。」
Harvard's decision to revoke Michelle Jones' acceptance demonstrates how some only support equality whn it lies in the realm of the abstract
— Clint Smith (@ClintSmithIII) 2017年9月14日
瓊斯最後選擇紐約大學，她指出自己在監獄擾嚷的環境中熬了20年，還能持續閱讀寫作，若還有人質疑她不夠格念博士，不僅低估了她的勇氣，也小看了監獄，「忘掉哈佛吧，我已經從最嚴酷的學校畢業了。」
