最值得一提的是，當天愛荷華號戰艦為了歡迎馬英九的到來，特別升上一面代表自由中國的青天白日滿地紅國旗，讓他享受到了元首級待遇。無論如何愛荷華號曾經搭載過美國元首，而馬英九又是中華民國前總統，這樣的禮遇也是實至名歸。愛荷華號戰艦的存在，其實也是美國協助中華民國政府收復台澎失土歷史的最佳見證。
見證民國史的中山艦
至於洪秀柱登上的中山艦，其實也有段不簡單的歷史。中山艦下水於1912年，為日本三菱長崎造船所為清朝北洋海軍設計的永祥級海防艦第2號艦。不過當永豐艦下水時，大清帝國已經因為辛亥革命而滅亡，這艘軍艦的交付對象自然而然成了中華民國海軍。仿佛中山艦在冥冥之中，就是為了中華民國這個國家所打造的。
永豐艦自1917年起，就參加孫中山先生領導的護法運動，從而與中國國民黨結緣。1922年6月16日，與孫中山合作多年的粵軍將領陳炯明叛變，孫中山也是即時登上永豐艦避難，才免去了被俘的危機。蔣中正則因為即時趕到永豐艦護駕，從而得到孫中山重用。甚至許多人認為，他能當上黃埔軍校首任校長與這次永豐艦的護駕行動脫離不了關係。
所以孫中山先生在1925年去世後，廣州國民政府將永豐艦命名為中山艦以紀念孫先生。不過孫中山先生的聯俄容共政策，導致大量共產黨員滲透到國民革命軍的陣營裡面，海軍自然也不例外，於是就有了爆發於1926年3月20日的中山艦事件。蔣中正判斷具有共產黨員身份的中山艦艦長李之龍，試圖將他綁架到蘇聯，於是先發制人逮捕李之龍，為即將到來的國共決裂拉開序幕。
站在中華民國海軍的立場，中山艦最後的光榮發生在1938年10月24日。此刻中日戰爭已經爆發，日本海軍航空隊以6架爆擊機將缺乏空中支援的中山艦炸毀於金口。全艦140名官兵只23人存活，戰死的艦長薩師俊也因而被中華民國視為海軍抗戰英烈的代表性人物。從中共的角度出發，中山艦則是一個可以強調「國共一家親」的統戰工具。
中山艦博物館
雖然薩師俊的叔公，清末海軍大元老薩鎮冰在1949年拒絕蔣中正的邀請隨政府遷台，投效了中共政權擔任政協委員，可薩師俊身為戰死於對日抗戰的中華民國海軍上校艦長，其事跡在毛澤東統治下的中國大陸仍屬政治不正確。直到1984年，中共政權開始以「實事求是」態度面對抗戰歷史以後，薩師俊才成為兩岸公認的抗日英雄。
中共政權基於打造所謂「愛國主義教育基地」，順便統戰撤退來台的老衣被國民黨人之需要，選在國父誕辰130周年紀念日的1996年11月12日展開中山艦的打撈工作。完成中山艦的打撈和修復工作後，中共又於1999年在金口成立占地面積468畝的中山艦博物館。復原後的中山艦，除了保存被日軍炸彈炸出的裂口外，還保留了象徵「抗戰中國」的青天白日滿地紅與青天白日兩面旗幟。
