衛福部立桃園醫院日前爆出新冠肺炎（武漢肺炎）院內感染，台北市衛生局前局長邱淑媞日前在臉書批評指揮中心嚴重欠缺防疫邏輯，引發網友討論當年台灣面臨SARS疫情時，和平醫院封院決定是否恰當。邱淑媞曾舉出當時公文，批評中央政府「下令立即封院，而且叫衛生局接管，自己不管。」對此，時任衛生署長涂醒哲回應，封院有助防止疫情擴散沒有錯，但要檢討的是「配套措施執行能力」太差，反而會造成更大的院內感染。對此，精神科醫師蘇偉碩也呼籲，「大家先看完再出征好嗎？」
涂醒哲提到，時任市長的馬英九曾表示，當年4月24日一早就召集邱淑媞及和平醫院院長吳康文做出管制人員出入的決定，後來馬英九指派副市長歐晉德及邱淑媞去行政院開會。專家學者接受台北市政府的決定，也做出台北市衞生局接管，中央全力協助的結論。涂醒哲指出，該公文由行政院衞生署依行政慣例，發文給台北市衞生局、台北市政府、和平醫院及疾病管制局，故其上有他的名字。
涂醒哲認為，封院決定有助防止疫情擴散沒有錯，但「配套措施執行能力」太差，反而會造成更大的院內感染。例如把人在外面可以自我居家檢疫的醫護人員召回，在衞生局配套未做好的情況下，讓醫護暴露在更危險的場所中。檢討專家群和台北市政府討論過的封院決定對或錯沒有意義，要檢討的是「為什麼沒有按照專家的建議做好封院的配套措施？」
對此，蘇偉碩表示，涂醒哲坦承那封公文就是要封院，2003年4月24日當天，行政院SARS會議出席的有行政院副院長林信義、涂醒哲、疾管局長陳再晉、歐晉德與邱淑媞。從監察院報告找到當天行政院SARS會議的5點結論，指出召回和平醫院全體員工集中治療是行政院會議後宣布的結論之一，當時涂醒哲也有參加會議。「大家先看完再出征好嗎？」
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