國軍憲兵部署重心放在首都衛戍區，相形之下外縣市及外離島憲兵兵力就顯得薄弱，12日傳出澎湖憲兵隊縮減員額，將多出來的兵員補到位於台北的憲兵229營，並新增一個連，且該連還將替前總統李登輝守墓，引發熱議；憲兵指揮部12日傍晚回應，強調兵力結構是因應敵情威脅及作戰需求調配，「一切以任務執行為考量。」
各地憲兵隊平時負責區域內的警備治安、特種勤務、重要廠庫警衛等任務，戰時則支援主力部隊作戰，執行戰地糾察、戰俘收容及逃兵查緝等，是地區憲兵勤務的核心，然而隨著時空環境不同，國軍歷經數次裁撤整併案後，憲兵人數已大不如前，各縣市憲兵隊長階級從上校到中校，但所屬憲兵官兵僅有數十人之譜，當中又因轄區特性形成人數差異。
此次外傳的澎湖憲兵隊原先已不到50人，如今部分兵力在另有他用情況下，再砍近半員額撥給其他單位，也凸顯當前大環境「又要憲兵好，又要憲兵不吃草」（不給員額）的詭異現況。移出的2、30名官兵，外傳去處為憲兵229營，該營隸屬負責首都衛戍的憲兵202指揮部，其主要職責為國防部和衡山指揮所等國軍機敏處所警衛。由於駐防點有重要軍事官署特性，因此被指將接下李登輝墳墓駐衛任務，確實不至於偏離主題太多。
不過消息曝光後仍引發反彈，逼得憲兵指揮部12日傍晚發布新聞稿回應，不僅鄭重駁斥，亦譴責有心人士造謠，意圖誤導官兵及家屬。
憲兵指揮部強調，因應敵情威脅及作戰需求，在考量兵力結構等因素下，根據現有人力做適當調配，「一切均以任務執行為考量。」
