事實上，這樣的制度代表著承包商在前3期的合約付款期間裡完全得不到淨收入，只能先自行墊錢來做海軍造艦案，對於一般民間承包商而言相當嚴苛，而且慶富的資本總額僅只有5.3億元，成為後來慶富爆發財務危機的導火線。
慶富不實增資，欺騙聯合貸款銀行
2014年11月，慶富為了籌措執行獵雷艦案所需資金，開始向一銀、合庫、華銀、台企銀、台銀、土銀、彰銀、農業金庫以及中國輸出入銀行等9家金融機構進行聯合貸款，由第一銀行統籌主辦與管理，以2%以上的利率，貸款新台幣205億元，須在8年內還款，但附帶條件是，慶富的資本額必須在2年內增資到70億元。 這是台灣近年少見、規模超過新台幣100億元的大型聯貸案，2016年2月4日合約生效。
2016年5月，慶富前執行長簡良鑑與董事長陳慶男因債務問題對簿公堂，簡良鑑聲稱，慶富為取得參與海軍獵雷艦的資格，以假債權、關係企業借款等方式，先後4次不法增資，讓慶富資本額從5億3000萬元暴增到30億元，藉此取得聯貸的205億元。
2016年7月，慶富向聯貸銀行申請貸款的抵押品，只有慶富所屬的港口機器設備與新台幣29億1000萬元備償專戶存款現金。獵雷艦案的進度拖延也讓外界質疑，慶富是否採取金融犯罪手法不實增資，欺騙九大官股行庫聯貸案。不免讓人懷疑，慶富當初僅以不到6億元的資本額，標到國防部352億的獵雷艦案，「是小孩玩大車」。
獵雷艦案引爆詐貸案，檢方著手偵辦
2017年8月，檢方正式調查慶富詐貸案，懷疑慶富涉嫌用假文件向多家銀行詐貸，涉及詐欺、偽造文書、背信等罪。高雄地檢署搜索慶富集團總部與公司負責人辦公室及住家等處所，約談董事長陳慶男、副董事長陳偉志等19人到案，陳慶男父子坦承詐貸，訊後獲檢方諭令父子2人各以800萬、500萬元交保。
根據調查結果，檢調指出，在2015年3月至2016年11月期間，陳慶男父子與顧問李維峰共同涉嫌先後四度向聯貸銀行團詐取貸款，由陳偉志設立多間境外紙上公司，並擔任實際負責人，再以慶富向多間境外紙上公司購買建造艦艇所需設備的虛偽合約或商業發票。檢方研判，估計詐貸總金額高達美金6733萬元。
另於2015年間，境外紙上公司所開立向慶富請領艦艇建造案款項的不實發票或不實合約，先後二度向銀行詐貸過渡性融資貸款，詐貸金額約美金710萬元。
慶富驚傳破產財務危機
詐貸案爆發之後，對慶富執行獵雷艦專案產生嚴重的影響，陸續有銀行對慶富進行追債，慶富面臨資金周轉困難的問題。2017年9月30日，慶富發函給總統府等單位尋求紓困方案，在函件內容中指明，「尋求資金挹注，若無，本公司提出破產聲請」
