國內5月中旬爆發本土疫情，全國進入三級警戒，輿論多將矛頭指向機組員檢疫期縮短為「3+11」是防疫破口；但疫情指揮官陳時中強調，「3+11」並非防疫破口，也未對社區造成影響，引起爭議。對此，衛福部草屯療養院醫師沈政男表示，如此說法雖有助為「3+11」辯護，但大家早在5月初就知道了。
針對「3+11」破口爭議，沈政男13日在臉書指出，陳時中強調華航諾富特案和萬華分別是獨立事件，因為未發現未華航案職場與家庭以外的社區接觸者感染，這樣的說法雖有助於為「3+11」辯護，但大家早就知道了。當時正因所有華航群聚社區接觸者未染疫，大家認為這一波疫情已經守下，結果病毒已在萬華散播。
沈政男進一步說，至於病毒如何自諾富特案傳播到萬華，除了傳統疫調以外，更可以利用電信足跡；他舉例，4月中旬，有確診機師到過北市清真寺參與400人聚會，如何確認無人染疫？當時正是因為不曉得參與者是誰，因此也不會被檢測。
沈政男更在文中提到，新北13日加零，當初唱衰市長侯友宜、有多少人認為不可能清零，但新北就是做到了。他也點名台北市長柯文哲，指柯近日被問及清零時又猶疑了；他認為，事實上清零之道無他，就是把電信足跡都描繪出來，但從最近的記者會看不出來有沒有做到這樣的程度。
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