花蓮在6日晚間發生震度7級的大地震，回顧2年前，高雄美濃大地震正好也發生在2月6日，當時台南新化也有7級震度的搖晃，兩起地震都造成大樓倒塌與民眾傷亡，但花蓮發生餘震次數是美濃的10倍以上。
根據中央氣象局地震測報中心的數據顯示，兩起地震雖然都發生在2月6日，但美濃地震釋放出的能量（約4顆原子彈）是花蓮地震（約0.5顆原子彈）的8倍之多，不過花蓮的餘震次數卻遠多於美濃地震，甚至發生有規模接近主震的餘震。
地震測報中心統計，花蓮地震截至9日上午，有感餘震次數發生260次，最大餘震更高達芮氏規模5.7；相較於2年前的美濃地震，震後3天內的有感餘震不到20次，規模最大也只有4.6。
地震測報中心技正蕭文啟表示，這兩個地震的地理條件完全不同，花蓮地震的震央位在花東縱谷，為板塊交界處，美濃地震的震央位於中央山脈西側，屬斷層破碎帶，餘震次數不同是合理的情形。
對於學者稱花蓮強震是美崙斷層因素，蕭文啟說明，除了有感餘震外，地震測報中心透過電腦蒐集到的數千筆強震後的無感餘震資料，未來均要藉由人工一一比對，描繪出花蓮強震的地底剖面圖後，才能斷言這次地震的原因。
