立法院本會期將審查明年度中央政府總預算案，但國民黨立委林思銘指出，2020年海基會9位主管級以上人員，平均每人領取近40萬的工作考績獎金，林思銘質疑，兩岸官方交流停滯下，海基會功能不彰，主管不應繼續享有如此高額獎金，擬提案明年預算予以減列。但亦有熟悉兩岸事務人士分析，海基會董事長薪水已從馬政府時期月薪23萬調降至部長級19萬元，獎金發放也一向比照公務體系，海基會仍須頻密處理台灣人在陸遇上各種情況，沒有「功能不彰」。
林思銘認為，兩岸官方交流因政治和去年起疫情等因素近乎停滯，海基會受政府委託辦理兩岸事務性協商，但海協會針對海基會傳真請求協助事項「已讀不回」，連海基會在2020年度決算中，也自承「自（民國）105年5月20日以來，陸方中斷兩岸官方及兩會的溝通管道，致本會『兩岸溝通、協調、聯繫及交流』預算未能執行，與計劃目標產生落差。」（延伸閱讀：陸委會「祕密經費」占比暴增至7成 藍委疑有小金庫之嫌）
據了解，海基會目前傳真至海協會的請求協助事項被「已讀不回」，但到底是壓著未辦、或處理其中一部分，或是接手處理請求協助事宜，進度有時不得而知，會是陳情人向海基會告知後方知情況為何。
