三月十一日早上七點左右，三位穿私服的人到李仁貴家，將他強行帶走。 陳炘、黃朝生、陳屋也都在十一日起陸續遭便衣帶走，失去音訊。廖進平家亦有便衣及憲兵來，他雖已避居友人家，卻於十八日遭人密告被捕。 但他們究竟被送往何處？如何處置？是否被槍殺？若已被槍殺，遺體又在何處？家屬透過各種方式，始終無法得知。
事實上，此波秘密逮捕的行動，陳儀已擬就名單。今天大溪檔案中與二二八有關的第一份名單，出現在三月十一日，考據後發現就是遭秘密逮捕之後被密裁的名單，也就是至今不知遺體何在者。 此份名單由陳儀親筆書寫，共二十人，點名四位政建協會成員：廖進平、黃朝生、李仁貴、陳炘。 這份名單寫得匆忙，都先冠以「陰謀叛亂首要」，還來不及註記略歷及「罪跡」，但唯獨對這四位，一個個寫上「政治建設協會」，可見陳儀對此一政治團體的在意，且列為首要滅殺對象，甚至是以秘密逮捕之後暗殺的方式對待。
兩天後，此份二十人的名單才一一補上略歷及「罪跡」，以「辦理人犯姓名調查表」的名稱補送給蔣介石。其中施江南明明是醫生，但他的略歷卻僅註明「政治建設協會理事」，至於「罪跡」欄，陳儀列不出半條事證，只冠以「陰謀叛亂首要」。 與三月十一日名單有所不同的，還有在工整的表格之外，最後又以潦草字跡加入白成枝、蔣渭川、陳屋、林日高、王萬福（應是王萬得）、張晴川、呂伯雄七人。 除林日高外，其餘六人皆是政建協會的重要幹部，所以這新增的「人犯」名單幾乎是對著政建協會而來的。其中蔣渭川是事件期間代表政建協會與陳儀主談判的人，三月十日早上尚不在任何「人犯名單」上時，已險遭槍斃，此時才以「後記」的方式將他列入。而因林日高、王萬得在日本時代曾加入共產黨，於此已可嗅讀出當局入罪的劇本會往什麼方向編寫了。
三月十一日的這份密裁名單，包括媒體、反對黨、司法改革三大領域的領袖，列在最前面的是媒體領袖，接著就是政建協會，廖進平第一個遭點名。三月十三日陳儀列他的「罪跡」是：「向美國駐台領事館提出『將此次台灣二二八事變真相向國內及全世界報導並請主持公道』之辱國要求，及經常利用該協會定期講演會，發表抨擊政府、不滿現狀、挑撥官民之荒謬言論。」
此一「罪狀」其實正點出政建協會為台灣發聲的努力。訴求國際早是台灣民眾黨從日本時代便已開始的模式，當時即到國際法庭控告日本政府的鴉片政策，更何況此時二二八事件是規模如此巨大的反抗運動，如何訴諸國際，免讓台灣被封鎖在島內，任專制政權為所欲為，困局如何突破，政建協會沒放棄努力。廖進平的演講早自日本時代即風靡人心，戰後台灣陷入再被殖民的處境，他立於街頭的演講，已是畫家筆下捕捉的風景，而有張義雄繪製其演講的作品。
