台大校長當選人管中閔遲遲無法上任，前教育部長潘文忠因此下台負責，爭議經過3個月餘，教育部終於在今（2）日晚間作出決定，以台大校長遴選有重大利益未迴避的適法疑慮，無法接受遴選結果，駁回管中閔當選台大校長案，必須所有被推薦人重新回到「資格初審」的程序，若是管中閔仍然當選，則會予以尊重。
林騰蛟：管中閔與蔡明興未利益迴避，台大有責任
教育部次長林騰蛟今日晚間表示，遴委會委員蔡明興及被推薦人管中閔有經濟法律上重大利益未迴避的適法疑慮，台大亦未善盡幕僚單位應有責任，進而形成對其它被推薦人的偏頗與不公平競爭，同時，亦出現明顯有違背學術誠信規範的情況。教育部無法接受台大遴委會此次的遴選結果，並駁回台大遴委會的決定，教育部亦要求台大及台大遴委會要重新在符合其自訂的校長遴選相關規範中，進行完整的推薦及遴選程序後依程序報部。
若管中閔再次當選 教育部會尊重
林騰蛟說明，台大校長遴選有4個自訂的程序，從被推薦人資格初審、遴委會第一次個別推薦投票、校務會議代表第二次投票、最後在進行遴委會最後票選。教育部要求所有被推薦人重新回到「資格初審」的程序，若管中閔繼續參與遴選，台灣大董事蔡明興則需迴避。林騰蛟說，因台大校長還沒產生，因此遴委會並未解散，若最後一切符合程序後仍是管中閔當選，教育部會尊重。
林騰蛟表示，台大校長遴選過程中，學術倫理、基本誠信未被彰顯，遴委會也沒遵守其自訂的各階段遴選基本準則，因此教育部無法接受台大遴委會此次遴選結果，並駁回台大遴委會的決定。
教育部認為，公立大學受全國納稅人委託，教育年輕人成為具有全人人格及專業技能的國家棟梁，學術誠信是大學必須具備的基本準則，當然要接受較高道德標準的檢視。台大2017年由政府提供的經費超過67億元，全校師生達到3萬7千人，從結構面來看，該校預算及師生人數已經超越某些政府的行政機關，台大校長的遴選作業程序不能輕忽。
陽明校長爭議 監察院調查中
同樣傳出遴選爭議的陽明大學校長郭旭崧，校長遴選委員會召集人張鴻仁身兼心悅董事，郭旭崧也曾擔任心悅生醫公司獨立董事，和管中閔情況相同。面對是否相同標準問題？林騰蛟表示，郭旭崧被檢舉是在教育部聘任後，教育部事先並不知情；但這次教育部會採同樣標準，檢視陽明大學在校長遴選案是否有同樣問題，監察院目前也在調查中。但在調查結果出來前，郭旭崧不需停職，仍可履行校長職務。
挺管派台大自主聯盟今日在台大鹿鳴廣場擺攤販售挺管T恤，標著「爺們」、「I AM FINE」等語。一向低調的管中閔更罕見現身替支持者簽名。台大自主聯盟表示，將在27、28日在台大鹿鳴廣場賣挺管T恤，希望鼓勵師生勇敢站出來，支持大學自治，唾棄政治黑手伸入校園。「挺管」T恤一件100元，一款前面印上「爺們」兩大字，背後則寫「挺管用的」雙關語，另一款則引管中閔曾在臉書寫下的「I AM FINE」。
