中央流行疫情指揮中心指揮官和任何人一樣，都有參選公職的權力，但要將指揮官的光環運用到選舉上、則會面臨兩難，尤其在亞洲國家因BA5疫情再起、前景不明的此刻，蔡政府及民進黨從上到下全黨護一人（陳時中）的戰法，左右的不只是台北市選情，更可能殃及關鍵的防疫判斷。
指揮官參選為何會有兩難？如果防疫做得好（何謂好在台灣並無共識），則這位指揮官最起碼的要能效法病毒無國界的原則，心中也不能有黨派，但一位心中無黨派的指揮官是否適合投入黨派激烈競爭的選舉，這可能需要「人設」大挪移，若因此前恭後倨，很難不令選民覺得突兀，這是指揮官參選的「人設」難題。
諷刺的是，陳時中擔任指揮官的黨派立場鮮明、政治性格強烈，卻反而為自己解套。2020年疫情初起時，陳時中主管的指揮中心力擋父母是陸配的小明從中國大陸返鄉，然而美歐疫情繼中國之後爆發，赴美歐的國人卻都可以順利返鄉，面對歧視、違反人權的質疑，陳時中當時還回以「對國籍的選擇要自己承擔」，政治正確的反中立場表露無遺，即使小明仍是台灣人的小孩。
小明受到歧視，多數國人也許不在意，但是從去年以來，無論是疫苗、快篩到防疫規範，陳時中的指揮中心和雙北紛爭不斷，最明顯的是去年6月開始打疫苗時採平均主義、不顧疫情嚴重性，當時在疫苗分配時最嚴重的新北分配數和高雄一樣，直到媒體與在野黨批評後才改變。今年四月下旬到五月上旬雙北疫情最緊急時，不顧雙北市長急如星火一再呼籲，指揮中心遲遲不肯開放快篩陽即確診的規定，任由醫院急診室及快篩站大排長龍，排擠醫療量能，這個也許不是指揮中心存心惡整雙北市民，但是雙北市長不屬於民進黨籍、不算自己人，所以第一線的呼聲無法即時得到中央正視，卻是顯而易見的。
所以，陳時中在部長交接儀式時第一句話就直接拜票，還反批質疑的聲浪是「矯情」，這不過就是陳時中政治性格的展現，從指揮官到市長參選人之間的角色，幾乎沒有轉換困難；但對於破壞黨政分際視為理所當然，將來選戰開打時，已為蔡政府動用行政資源助選排除該有的道德底限。
可以說，心中有黨派的指揮官不可能是好的指揮官，而表現受質疑的指揮官轉任成民進黨全力輔選的參選人，對國家的傷害可能遠甚於選舉的不公平。例如，台灣防疫的表現到底好不好，就成為政黨攻防、無法客觀討論的問題，之前還曾對英國媒體衛報反省台灣準備不夠的副總統陳建仁，在擔任競選總部主委後第一次發言就公開盛讚陳時中是「世界性的防疫英雄」，很顯然，蔡政府和民進黨就是要拿著陳時中所剩不多的防疫紅利來打選戰，當陳時中被吹捧成「防疫英雄」，台灣有可能檢討指揮中心過去的失誤、從中學到教訓來對付日益精進的新冠病毒？
