前新竹市長林智堅被台大學術倫理審定會核定2017年的國發所碩士論文抄襲，建議撤銷碩士學位。國民黨新竹市長參選人林耕仁10日指出，2018年林智堅參選新竹市長連任的選舉公報上，學歷是台大國發所，儘管林認為不影響他的選舉，但這會影響新竹市民、甚至桃園市民對他的信任。如今林智堅的台大學位被撤銷，林耕仁認為，林智堅必須為曾經相信他的新竹市民鄭重道歉。
另一方面，國民黨指林智堅市長任內，新竹市眷村「將軍村」修復案高達2.4億元，但得標廠商沒有古蹟修復經驗，且第1期跟第2期工程延宕到至今已逾4年，國民黨新竹市議會黨團9日也發出譴責聲明。林耕仁指，將軍村修復工程，新竹市政府找「零經驗」的廠商，沒有任何相關修復經驗，還花費高額費用，跟新竹棒球場修復工程如出一徹，是「假專業之名，行傷害專業之事」。
林耕仁指，這段期間，未見執政的民進黨議員站在市民角度、為民發聲，反而監督起履行監督職責的人，完全就是背離民意所託，未盡替市民做好市政把關之責，嚴重違背民主精神，背棄新竹市民託付的行徑。
林耕仁10日上午與新竹市議員鍾淑英、段孝芳，議員候選人張文興、陳清智等徒步行走東區建功里、中正台周邊懇託拜票。「我不用走入群眾，因為擔任議員24年來，每一天都與民眾站在一起！」林耕仁強調，隨著年底選舉到來，他會把握每一天與市民接觸的機會，了解城市與民眾的需要，承諾做「最照顧市民的市長」。
另一方面，媒體問及前天到新竹縣拜訪縣長楊文科，談未來若當選的縣市合作議題，林耕仁表示，新竹縣、市政府過去7年半以來幾乎是平行線，沒有太多交集，雙方都認為新竹縣、市要走向共榮共好，未來新竹縣、市的市政推動要以「大新竹生活圈」理念出發，推動軌道運輸及改善公車路線並進、推動大永續新竹以及環境保育、發揚客家文化等議題，強化縣市合作，提升政府效率，發揮1+1大於2的效果。
沈慧虹力挺林智堅 林耕仁：和台大公信力相比一目了然
對於民進黨新竹市長參選人、前副市長沈慧虹9日發文力挺林智堅「不會抄襲」，林耕仁回應，如今台大校方認定抄襲明確，林智堅誠信問題備受質疑，作為前副市長的沈慧虹欠新竹市民一個道歉。他提到，沈慧虹等同指控台灣最高學術殿堂台灣大學抹黑林智堅，台大遭到這樣惡意攻訐，他要替台大及所有校友抱不平，林智堅、沈慧虹「烙跑二人組」和台大，誰比較有公信力，完全一目了然。
