民進黨桃園市長參選人林智堅碩士論文爭議延燒，台大9日召開記者會認定林智堅抄襲，決議撤銷林智堅碩士學位，不過林智堅仍堅持自身清白，民進黨包括前副總統陳建仁也力挺。對此，台北市長柯文哲痛批，現在的民進黨已不是當年認識的民進黨，為了一時選舉勝敗，連台大都要毀掉。
柯文哲表示，自己是台大畢業，也是台大醫學院的教授，林智堅碩士論文爭議客觀來講，身為林智堅指導教授的國安局長陳明通要負最大責任，陳明通怎麼會把同份資料給2個學生寫？且這2名學生寫的東西幾乎相同，陳明通自己要檢討，「你怎麼會發畢業證書給他們？」
柯文哲：陳明通指導173個碩博士生，只有5人將論文上網公開
柯文哲提到，這麼多年來聽過很多傳聞，陳明通指導的173個碩博士生中，只有5人將論文上網公開，其他168個都不公開，這些一查下去都會是問題，但真正要檢討的是「這個問題到今天才出現嗎？」這麼多年來，難道台大社科院或其他學院的老師都不曉得這件事嗎？為什麼讓此事拖到現在才曝光？「我非常清楚啦，不是只有林智堅1個，一狗票啦！」
「應該是防微杜漸，在問題還不是問題時做處理。」柯文哲認為，現在問題變得這麼大，當然是台大的不幸，台大自己要去處理，只能說現在的民進黨，已經不是他當年認識的民進黨了，為了一時選舉勝敗，連台大都要攻擊、毀掉，「這實在是，不要為了政黨利益犧牲國家長期利益，這件事情我是有無奈，我看感傷的成分更多。」
柯文哲：這個國家亂掉了
有媒體追問是否贊成台大調查陳明通？柯文哲回應，以醫學院教授看待社科院此事，仍認為老師要負最大責任，但也知道這不是個案，「這整個案子到現在，我只能用1個字形容『Ugly』啊，這實在是太醜陋了。」
至於民進黨包括陳建仁都表態力挺，稱台大沒有充分納入當事人林智堅的論證，柯文哲認為，「人家開審查會叫你來報告你又不來，人家報告出來你又在外面放砲，唉我已經沒有想說的了，算了，這個國家亂掉了。」
