讓他踢到鐵板的是馬英九，馬英九當選台北市長後，李曾跟馬反應有人在選舉時揚言對他暴力相向，馬英九不但沒譴責，還說「我選舉時也曾被人從後面打了一拳 」，馬的回應與顯現的人格特質讓他失望；而馬在當選總統後，他因為轉述（頂新）政治獻金案，差點吃上官司。他不喜歡馬英九，馬英九多半也不喜歡他，因為教改，因為李登輝，因為他挺扁，李遠哲很大程度成了「藍營」的眼中釘。
蔡英文二０一二年第一次競選總統時，李遠哲就為她站台，為宇昌案背書，強調宇昌是很好的生技公司；二０一六年第二次競選總統，李遠哲在選前一周選前兩天都站台輔選，規格已經超過二千年的聲明與視訊挺扁，台上的蔡英文則承諾「當選後掃除黑金」。李遠哲自陳與蔡英文已經無法再溝通的原因，是為了二０五０淨零排碳議題，蔡英文的反應竟然是「那是下一代的事，我只做到二０二四。」但他對自己被排除列名總統府資政，却有黑道躋身國策顧問，不會無感，但不論是淨零排碳或者掃除黑金，對賴清德、甚至任何一位國家領導人，都是重中之重的難題。
選總統，誰敢把「放棄追求經濟成長」當政見？
掃除黑金，簡單一點，畢竟只要各政黨負責任地排除提名黑道，不收受不當獻金，拒絕特權標案，即使做不到弊絕風清，也不至淪落「黑道治國」，為什麼做不到？只能說權力的誘惑，讓人太輕易就與魔鬼交易，從大權在握的李登輝為了選總統都會讓黑道立委當大樁腳，即可見一斑，所謂「千里之堤潰於蟻穴」，黑道靠政治漂白，大盛於李登輝執政末期，但政黨輪替三次再無從根絕，如今甚至能堂而皇之成為「英派」，賴清德的難題不在掃除黑金，而在「身處非常不民主的政黨中，如何掃除派系惡瘤」？賴清德連高端疫苗都抗拒不了，如何抗拒派系？講直接一點，這個瘤讓國民黨除可能比民進黨自清要容易，畢竟沒了權力就沒了他們賴以生存壯大的土壤。
淨零排碳，就是個不可能的任務！蔡英文的錯不是做不到，而是她應該像陳水扁耍無賴般誠實以告「台獨做不到就是做不到」，告訴李遠哲「放棄經濟發展和GDP達到淨零排目標」，無異於自殺。這不是台灣的難題，而是全球的難題，李遠哲有科學家的誠實，直言二０五０淨零排碳不會帶給我們更美好的世界，只是讓更壞的世界「壞得少一點」，要地球放緩破損的速度，李遠哲的建議是不要老談經濟發展和GDP，領導人要呼籲大家節衣縮食，過著簡單更簡單的生活，這是科學家的奔走呼籲，政治家能喊喊口號已大不易，美國經濟發展重挫，拜登政府眼看都可能垮台；中國經濟成長倒退，習近平的中國夢做不成，還有國家崩潰之虞；台灣連股市跌幾百點，都要動用國安基金護盤，哪位競選總統的人膽敢把「節衣縮食，放棄追求經濟成長」做為政見？對兩岸形勢緊張身處兵兇戰危之際的台灣而言，可能更需要李遠哲的另一個意見：全球科學家再次大聲疾呼「世界一家，戰爭不是解決紛爭的方法」。
不論如何，李遠哲一番訪談，形同畫出道來，對國民黨而言，沒什麼壓力，橫豎他們早不把李遠哲當成必須拉攏的大神，但對賴清德而言，却是近難遠不得的招牌，畢竟二０二０年他與蔡英文競爭初選時，李遠哲已經公開連署聲明支持，如何表現出李遠哲心目中「標準分數算高」的「政治家風範」？從此刻起就將如影隨形跟著賴清德，迎來的會是嘲諷還是捧殺？難以逆料，唯一可以慶幸的是，賴清德比其他有志大位的政治人物，更早開始解題，能不能做出漂亮一點的答案？對比李登輝、陳水扁、蔡英文，李遠哲應該也會很快重新打出他的分數。
