這次南投立委補選，國民黨候選人兩任縣長八年的林明溱竟然意外輸給民進黨的蔡培慧，有人歸罪侯友宜在選前之夜沒有與其他三都市長一起參加造勢活動，是敗選的原因之一。雖然黨內大老大多為他緩頰，認為罪不及他，即使參加也不一定能因此反轉選情。
當然國民黨敗選的原因不只一端，但看在深藍選民的眼中，認為侯友宜確實有點太本位主義，身為最可能擔任國民黨競選總統的候選人，缺乏對黨的熱心與團隊意識，參與是對黨尊重與團隊意識的儀式與態度，也許他認為以南投深藍的地區，不須他多此一舉的表態也穩贏，但也有綠媒名嘴諷刺他太過權謀精算，勝選對他爭取黨內提名出線無多大助益，讓朱主席輔選四連勝反不利他黨內惟我獨尊出線的地位，敗選則有損他目前的高光，所以以不參加為上策。更有人懷疑他的高調是否自認為自己的名氣媚力已高過黨，所以不甩黨的號召，我行我素。
雖然事後他也解釋當日他已有安排固定的行程不便前往參加，但這樣的解釋顯然不夠誠懇，難道有不能找人代替他的行程，其他三都的市長都不忙嗎？事後他假如能謙虛的表達因一時考慮欠周未能配合黨的步驟而道歉，可能會感動深藍選民與諒解，但他不僅沒表歉意，還犟說「選舉只是一時，勝選的人應更積極為國為民做事，輸就虛心檢討、調整步伐，不同角色一樣可以為人民做事，大家同心齊力，中華民國台灣就會更好。」這種冠冕堂皇言不由衷的八股空心話，徒使人感到他再次使出已令人覺得效果疲乏，甚至有點厭惡的「好好做代誌」口頭談而已，缺乏帶領藍軍衝鋒陷陣的領袖格調與熱忱。
何況此事朱立倫事前有邀請他，許淑華也因選情告急而特地請假三天傾力輔選，但他卻等閒視之，不當一回事，難怪藍營有人質疑他是「藍皮綠骨」王金平的翻版，更有藍營欲選立委的人士質疑一旦他成為國民黨的總統候選人，是否能充分發揮「母雞帶小雞」的熱忱，傾全力輔選，還是依然自己自我感覺良好「好好做代誌」就好這種論調，對輔選敷衍了事。
此事更令人想起2019年九合一大選時他與盧秀燕、韓國瑜三人組成猴子、燕子、禿子聯盟造勢競選，結果三陽開泰，各創奇蹟。猴子在新北獲得全國最高票勝立，燕子在台中扳倒競選連任的林佳龍，禿子更演大驚奇翻轉民進黨根深蒂固的大本營高雄市。
但當寒流風暴襲捲全台拱出韓國瑜冒著「落跑」的風險，參與國民黨總統提名初選時，以當時侯友宜居「北霸天」的氣勢卻能完全不動聲色，沒有絲毫與韓爭鋒的表態，但當韓國瑜出線當國民黨總統候選人到台北辦理大型造勢活動時，當時的民進政府傾全力打壓杯葛韓國瑜不餘遺力，毫無行政中立可言，但侯友宜不僅未積極參與造勢還要求新北市政府下屬必須嚴守中立，違者將予議處。看在韓陣營的眼中，簡直就是置身度外「站高山看馬相踢」毫無當時聯手競選「九合一」時的革命情感可言，難免令人遐想他的心機是否不願見到韓國瑜要是當上總統，他至少要等八年才有機會問鼎大位，且結果真的還是他老謀深算，比韓國瑜沉穩遠見。韓國瑜跌落神壇，他韜光養誨四年後，終於輪到他問鼎大位的機會。
