第三項因習近平集權而被破壞的慣例是「黨政分開」原則徹底遭破壞，黨政關係由習近平執政前期的「以黨領政」，逐步發展成今天的「以黨代政」。
習近平任內兩度推動機構改革
今(2023)年3月16日，中共中央、國務院公布《黨和國家機構改革方案》，並通知各地區、各部門結合實際狀況，認真貫徹落實。中共在2018年已進行一次機構改革，且變動幅度之大，堪稱歷來之最，何以在短短5年後，再次推動機構改革，備受各界矚目。
一、2018年機構改革
2018年2月26日至28日，中共第19屆3中全會通過《中共中央關於黨和國家機構改革的決定》和《深化黨和國家機構改革方案》，前者屬於框架性改革原則，後者則包含具體執行方案，並且被提交第13屆全國人大第1次會議審議。
該次改革，涵蓋黨中央、全國人大、國務院、全國政協、行政執法體制、軍警、群團組織、地方機構8個領域，其中又以黨中央及國務院改革為最主要面向。在黨中央機構改革方面，共有20項：(1)組建國家監察委員會，與中央紀律檢查委員會合署辦公，不再保留國務院監察部、國家預防腐敗局；(2)組建中央全面依法治國委員會；(3)組建中央審計委員會；(4)中央全面深化改革領導小組、中央網絡安全和信息化領導小組、中央財經領導小組、中央外事工作領導小組改為委員會；（5）組建中央教育工作領導小組；(6)組建中央和國家機關工作委員會，不再保留中央直屬機關工作委員會、中央國家機關工作委員會；（7）組建新的中央黨校，將中央黨校和國務院國家行政學院的職責整合，實行一個機構兩塊牌子，做為黨中央直屬事業單位；（8）組建中央黨史和文獻研究院，不再保留中央黨史研究室、中央文獻研究室、中央編譯局；（9）中央組織部統一管理中央機構編制委員會辦公室；（10）中央組織部統一管理公務員工作，將國務院人力資源和社會保障部所屬之國家公務員局併入中央組織部，對外保留國家公務員局牌子；(11)中央宣傳部統一管理新聞出版工作，將國務院國家新聞出版廣電總局的新聞出版管理職責劃入中央宣傳部，中央宣傳部對外加掛國家新聞出版署（國家版權局）牌子；（12）中央宣傳部統一管理電影工作，將國家新聞出版廣電總局的電影管理職責劃入中央宣傳部，中央宣傳部對外加掛國家電影局牌子；(13)中央統戰部統一領導國家民族事務委員會，將國務院國家民族事務委員會歸口(「歸口」係行政隸屬或接受業務領導之意)中央統戰部領導；(14)中央統戰部統一管理宗教工作，將國務院國家宗教事務局併入中央統戰部，中央統戰部對外保留國家宗教事務局牌子；（15）中央統戰部統一管理僑務工作，將國務院僑務辦公室併入中央統戰部。中央統戰部對外保留國務院僑務辦公室牌子；(16)優化中央網絡安全和信息化委員會辦公室職責，將國家計算機網絡與信息安全管理中心由國務院工業和信息化部管理調整為由中央網絡安全和信息化委員會辦公室管理；(17)不再設立中央維護海洋權益工作領導小組，將維護海洋權益工作納入中央外事工作全局中統一謀劃、統一部署，在中央外事工作委員會辦公室內設維護海洋權益工作辦公室；(18)不再設立中央社會治安綜合治理委員會及其辦公室，有關職責交由中央政法委員會承擔；(19)不再設立中央維護穩定工作領導小組及其辦公室，有關職責交由中央政法委員會承擔；(20)將中央防範和處理邪教問題領導小組及其辦公室職責劃歸中央政法委員會、國務院公安部(前者負責政策規劃，後者負責政策執行)。
