中選會從第二階段公投連署收件前放話，就算9月6日以後收件，也來不及公投綁大選，造成起步較晚的「以核養綠」公投小組恐慌，當心會被做掉，黃士修等人9月6日遞交第二階段連署書，由中央選舉委員會先點收31萬4135份，也要求保留有2次補件機會；為確保公投連署書有效門檻，又於9月13日至中選會提交約2萬4仟份的連署書補件，但卻遭到「公投行政為時限行政」拒收，以核養綠的發起人黃士修痛批此舉違法，並發起絕食抗議，要求中選會尊重民主價值並依法行政。（註：9月18日晚間已強制送醫）
中選會曲解法令只能收一次於法無據
中選會原本不看好沒有政黨奧援的「以核養綠」公投案能够成案，開始即百般阻擾，從放話就算9月6日或之後時間送件，也不能趕上連署書之審查時間；為確保在法定時間能趕上公投綁大選，與中選會聯繫過後，一位選務處人員透露，公投案的審查有分兩個階段，第一階段，在第一時間提交後，中選會便會審查其數件是否符合法令規定，若未達標準的話，便會退件，但若初審有通過的話，便開始第二階段，也就是將連署書轉交給戶政機關，由他們進行審查，以核養綠公投案目前是進行到第二階段。
但中選會看到「以核養綠」公投案達到法定門檻，為什麼還要拒絕補件？為了防範中選會放話要嚴審連署，還要成立筆跡鑑識小組，造成審查不公，對其後續來不及造冊的24,000份連署書，並對連署人有所交待；黃士修強調，依照現有流程與相關法令，公投綁大選最後期限應是9月14日，但陳英鈐不願也不敢公開承認；真實情況是，陳英鈐三番兩次透過媒體放話，甚至多次點名「以核養綠」公投，說中選會人手不足、作業時間不夠、沒預算，不斷將截止期限提前。
因此，就現階段而言，在法定期間9月14日截止前，仍然是有效的連署書送件時間。中選會曲解法令只能收一次，確是於法無據。而13日補送2萬多份連署書，即屬法定送件的有效連署書，中選會拒收理由既然於法無據，法有不足就應讓從寬認定。但中選會主委陳英鈐於17日接受「POP搶先爆」專訪，希望黃士修珍重身體，表示樂意繼續溝通，但強調中選會要守法。但根據公投法第13條，沒有任何一個文字說一定要一次送件，不能再補，但中選會為何刻意曲解法令只能收一次，其目的只有一個，就是讓「以核養綠」公投無法公投綁大選，明顯惡意阻擋！
結合議題老車自救抗議《空污法》修法
同時，另一邊全國老車自救會於9月14日至17日在立法院、行政院周邊抗議《空污法》修法，各式大型貨卡車三百多輛集結台北街頭。台北市中正一警分局發布新聞稿表示，全國老車自救會自14日清晨6時至17日深夜10時止，在中山南路、濟南路、仁愛路及凱達格蘭大道等路段舉辦「抗議空污法修法」集會遊行活動。全國老車自救會集結立法院週邊道路，高喊「老車無罪」，指政府以空污之名，剝奪人民財產及生存權之遊行，自14日清晨6時開始針對中山南路等路段實行階段性管制，並以行動劇演出抗議活動，甚至於有抗議民眾抬出棺材表達對空污法的不滿，讓台北街頭更顯得不平靜。
