行政院長賴清德12日宣布停建深澳燃煤電廠，並指全案是在新北市長朱立倫擔任行政院副院長時核定，對此新北市政府立刻回應，說深澳燃煤電廠案是蘇貞昌任行政院長任內核定。但行政院深夜時又發新聞稿回擊，指出新北市政府「選擇性誤導大眾」，「這是不對的行為」。
賴清德12日下午接受質詢，被同黨立委劉建國追問「當初到底是哪個幕僚說深澳非蓋不可」。賴清德回應，「你想我可以檢討當初核定的行政院副院長朱立倫嗎？」對此，新北市政府晚間發出聲明，強調深澳燃煤電廠案從計劃核定、環評通過、公告到編列預算，都是蘇貞昌擔任行政院長時完成，根本與朱立倫無關。
行政院則在深夜發出新聞稿，表示2010年朱立倫擔任行政院副院長時，在「行政院節能減碳委員會議」中明確裁示：「目前台電公司已提報之火力電廠汰舊換新計畫，請經建會儘速審議，並協調相關部會解決遭遇問題。」而台電公司在該次會議所提出之簡報即把深澳電廠、林口電廠、大林電廠、通霄電廠等均列為「進行中之屆齡汰舊換新計畫」，新北市政府卻發新聞稿指出深澳燃煤電廠已經不再發電，不在會議討論範圍，此實為混淆視聽。
行政院表示，2010年朱立倫當副院長時，還為「深澳燃煤電廠更新計畫」編列了3.8億元的經費，2011、2012年再編2.2億及5.2億元的更新經費，且列為行政院管制的重要計畫。
行政院強調，這些都是網路公開即可查到的資訊，也代表深澳燃煤電廠在國民黨執政時期、民進黨執政時期，都是國家能源政策中的一環，而今新北市政府卻選擇性誤導大眾，這是不對的行為。
