而港珠澳大橋原定2016年通車，因為物料供應不足、環保規管及勞工短缺的問題，要等到2018年才通車。加上2011年發生了一宗有關環境評估報告的司法覆核，政府說官司令工程延誤，增加幾十億港元的成本。
香港公共專業聯盟創會主席黎廣德認為，香港這幾年來進行多項大型基建，超出工程界負荷，出現「搶工人、搶機器」的情況，令一單工程延誤便引發多項工程「骨牌式」延誤，繼而成本上升引發超支。
他批評，港府在籌劃大型基建時，沒有做好工程評估，而官員也不是因為超支延誤等問題被問責。
「這是政治制度失敗的後果，令到官員就算出事，立法會有建制派支持，無法向他追究，也是因他不是民選，所以不用下台，超支延誤不會有後果，」他說。
港珠澳大橋的五個重要數字
主橋成本 RMB¥480億
香港支付成本 HK$1201億
大橋預計壽命 120年
預測2030年每日車流量 2.9萬
工傷死亡人數 18人
來源：三地政府、港珠澳大橋管理局
（二）實質效益成疑
時任廣東省省長黃華華2008年曾經表示，港珠澳大橋36年便可以回本。
根據2008年估算，大橋使用初期車流量為每天9.2千架次，到2030年會升至3.3萬架次，但2016年，三地政府調低評估，2030年車流量會預計會是2.9萬架次。
港府稱，調低預測是因為深中通道興建、跨境陸路運輸下跌及大陸鐵路發展。由於一些連接的公路還未完成，也影響了大橋初期的流量。
根據港珠澳大橋管理局近日公布的數字，小型客車收費為每車次150元人民幣（編按：約合新台幣670元），大型客車、過境巴士200元（編按約合新台幣893元），穿梭巴士300元，普通貨車60元，貨櫃車115元。
BBC中文用當局2008年預測的初期車流量，即每日約9000架次，再假設平均每輛車支付200元過橋費，得出一年基本車費收入約6.57億元人民幣，但首年單是香港口岸及連接部分的維修費用便高達2.7億港元，未計算營運成本及其他部分的維修保養費等開支，餘下不足4億。
「港珠澳大橋能夠收回成本可以說是天方夜譚，」身兼交通事務委員會委員的公民黨立法會議員陳淑莊對BBC中文說， 「大橋是否能做到收支平衡，我也相當懷疑。」
中國國家主席習近平（中）去年視察港珠澳大橋香港接線工程的進展。
目前，要通過大橋來往三地需要「雙牌」車輛，即同時擁有兩地的車牌，否則只能停泊口岸區附近，再轉乘接駁交通工具。
