後來，貝托魯奇獲得英國製作人湯馬斯（Jeremy Thomas）的支持，拍出獲獎無數的經典電影《末代皇帝》（The Last Emperor，1987年），這部電影也是首部獲得中國政府准許，進入北京紫禁城拍攝的外國電影，刻劃清朝最後一任皇帝溥儀從榮華富貴至孤獨凋零的一生。《末代皇帝》橫掃隔年的奧斯卡獎，一舉抱回最佳影片獎與最佳導演獎等9項大獎。
貝托魯奇與《春光乍洩》（Blow Up）導演安東尼奧尼（Michelangelo Antonioni）、（Federico Fellini）、《8½》（Otto e Mezzo）導演費里尼、帕索里尼同為義大利新浪潮電影的代表人物。2003年，貝托魯奇因為椎間盤突出而接受手術，但手術失敗，他從此無法行走，只能坐輪椅。2011年，貝托魯奇在坎城影展（Cannes Film Festival）獲頒終身成就獎。
#MeToo運動興起 貝托魯奇再次捲入爭議
2016年，好萊塢知名製片人溫斯坦（Harvey Weinstein）性侵與性騷擾醜聞引爆了好萊塢反性侵性騷的「#MeToo」運動。貝托魯奇在2013年接受《法國電影園》（La Cinémathèque française）的訪問再度被提起，引爆爭議。他在那次訪問承認，電影《巴黎最後探戈》中，男主角馬龍白蘭度用奶油當潤滑劑，性侵女主角施奈德的片段是他與馬龍白蘭度的點子，當時並未取得施奈德的同意。
該片段讓施奈德留下很大陰影，她在2007年接受《每日郵報》（Daily Mail）訪問時直言，「我覺得很羞辱，老實說我真的有點被強暴的感覺，施暴者就是導演和馬龍白蘭度。」施奈德在2011年因癌症過世，貝托魯奇在2013年接受訪問時表示自己很有罪惡感，但並不後悔這麼做，唯一懊悔的是自己從未因這件事向她道歉，「她恨我恨了一輩子」。
