九合一大選國民黨一雪四年前慘敗恥辱，一舉奪得三都十二縣共十五個執政縣市，選票也從約四九九萬票大幅成長到逾六一○萬票。
由於人氣高漲的韓國瑜順利攻下高雄市，黨內權力結構得以保持穩定，明年總統提名仍不脫黨主席吳敦義與新北市長朱立倫相爭的格局。
韓流勝選，藍營內鬆一口氣
選前最令黨內憂心的，是藍營新太陽韓國瑜未贏，選後趁勢挑戰黨主席吳敦義地位，甚至挾高人氣爭取黨內提名，直攻二○二○年總統大位，將形成吳、朱、韓三雄競逐的複雜局面。幸好選舉結果韓國瑜、侯友宜等中生代均勝選，未來勢必專注市政經營，對於國民黨改造及總統提名，預期僅會保持影響而不參與的態勢。
吳敦義雖掌握黨務系統，但人氣、形象皆遜於朱立倫，加上選前母豬說嚴重失言衝擊選情，導致多數藍營縣市長候選人與他畫清界線，外界一度認為吳已喪失代表藍營參選總統的正當性。所幸國民黨大獲全勝，吳確立勝選主席的地位，又重新站回能與朱抗衡的制高點。
而在出席開票當晚黨中央勝選記者會時，吳敦義更藉著支持者高呼「選總統」的氛圍，趁勢對黨內外展示挑戰大位的企圖心，以及握有制定初選遊戲規則的當家優勢。
吳敦義說，這不是可以隨便宣布的，一切要依據公平體制進行，就像這次縣市長提名一樣，品德、操守、能力、經驗都要能被大眾信任，對中華民國和國民黨堅定忠貞，「適當時間才會有機制出現，自己現在還沒動這腦筋！」
一位黨務要角指出，吳敦義很清楚地傳達了兩個訊息：一是他有能力及條件，也很篤定會參選總統，但表態時機還要好好思考；其二是初選機制由黨中央決定，目前剛勝選還不急，要等「適當時間」才會提出來。顯然吳也知道他的聲望還有待拉抬，必須以時間換取空間，才能與朱立倫一戰，因此黨內總統提名機制恐會拖到明年農曆年後才能定案。
新科百里侯多位親朱派
目前聲勢居上風的朱立倫，不但民調支持度遙遙領先，黨內人和也優於吳敦義，國民黨立院黨團多數立委與朱關係良好，人氣回溫的前總統馬英九似也較傾向支持朱。
新當選新北市長的侯友宜、準台中市長盧秀燕，及雲林縣長勝選的張麗善都是親朱派，參選桃園市長、台南市長的陳學聖、高思博更屬嫡系朱家軍，尤其接班人侯友宜在新北市拿下一一六萬票的好成績，更讓朱的行情水漲船高。選後朱立倫也立即表態，待本月二十五日卸任後，將與台灣民眾站在一起，未來不排除任何可能。
親朱人士強調，這次選舉韓國瑜快速崛起，凸顯民眾喜歡坦率的政治人物，朱立倫對是否要選總統，卸任前後一定會交代清楚，絕不會扭捏作態，希望黨中央能及早整合黨內意見，制定公平且能充分反映民意的初選機制，確保獲得國民黨提名者，就是最有勝算的人選。
朱立倫期盼初選機制能早點確定，反觀吳敦義則打算能拖就拖，三日他甚至以二○年總統大選可能與立委選舉分開舉辦為由，宣稱可能要到明年五、六間再啟動總統提名黨內初選。兩人立場的分歧，也讓國民黨在勝選喜悅的表象下，爭鬥的暗潮日益洶湧。
選後吳、朱交手第一戰，就是黨中央率先出招，打算修改黨章，讓新當選的十五位縣市長成為當然中常委。吳敦義也表明，將邀請藍營縣市長就職後每周參與中常會，讓黨意與民意同呼吸。由於現有三十四席中常委挺吳派居多數，吳的如意算盤是，若能成功拉攏新科縣市長，將可大幅強化中常會決議的正當性，有助制定出有利現任主席的初選機制。
朱立倫當然也非省油的燈，他立即提醒國民黨的改造，應讓真正代表民意的基礎成為黨的決策核心，「不能只是用加法」；言下之意是，代表民意的縣市長若列席中常會就應享有決策權，不宜要他們為現有中常委的決定背書，這也等於是警告黨中央，最好打消比照新竹縣長提名前例，由中常會閉門造車擬定初選機制的想法。
民調排不排綠出現爭議
由於藍營內部對吳、朱之爭恐造成黨內分裂的憂慮日深，以立院黨團總召江啟臣為首的「透明新連線」多位藍委，選後就曾聚會商討對策。一位與會藍委指出，最重要的是初選機制要透明公平、貼近民意，不宜再搞密室協調，「看起來全民調還是最可行的方式」。
不過也有黨務高層認為，為避免綠營選民介入民調，刻意讓國民黨較弱人選勝出，「適度排綠的全民調才比較周延」。
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