南鐵東移案是在2009年由國民黨的行政院核定。南鐵路地下化的工程單位也是交通部，非南市府。此外，南鐵沿線居民世居當地數代，血統上他們是民進黨定義的正港台灣人，意識形態上更長年支持黨外民主運動，甚至台灣獨立，符合民進黨的政治正確。那麼，為什麼反南鐵運動的抗爭總是針對賴清德與民進黨？這個疑問不但一再由賴清德，段宜康與其他民進黨政客在媒體上宣傳，也令許多不明本案的民眾所不解。
此外，反核、洪仲丘案、反媒體壟斷、反服貿黑箱、反課綱等主要以國民黨為標靶的社會運動總能引起較多的媒體關注與民眾參與。與南鐵案同樣主張土地正義的士林王家、苗栗大埔、林口A7等案雖一路艱辛抗爭，但也不致於如南鐵案竟受到某些標榜進步力量者的公然汙衊抹黑。
顯然，與民進黨或明星政客為敵，實在不符現在打倒國民黨的潮流，也較難獲得公眾同情。若以爭取公民社會支持為考量，南鐵抗爭實在應「選擇」被公認為萬惡的國民黨，或被公認為醜陋的劉政鴻為抗爭對象。無奈，這種選擇權並不在被迫害者這邊，而在於有權勢的政客手上。在情感上或情勢考量上，南鐵居民皆百般不願與民進黨及明星市長為敵。被迫害者唯一的武器就是「事實」，而真相只有一個。南鐵案自始至終都是民進黨規劃的謀財害命案，如下所述：
一、南鐵地下化自民國85年起一直都是以原軌地下化為設計原則，因為如此才能以對民眾最少侵害方式完成。直到民96年5月民進黨的台南市府以「土地開發、財務考量、有利第二階段區段徵收」為由，向陳水扁政府提出南鐵東移擴大徵收案。
二、民國96年10月23日陳水扁政府的經建會議裁示「鄰近區域一併辦理都市更新計畫、以土地開發效益挹注工程經費」要求鐵工局規劃南鐵東移案。
三、居民剛開始時相信賴清德與民進黨，甚至找來工程專家協助南市府辨清鐵路東移並無必要。但是換來的是賴清德一系列的謊言、抹黑、栽贓，甚至挑撥西側居民與東側居民對抗。
四、南市府負責擴大徵收之騰空土地與周邊土地重劃的規劃，賴清德取得完整市區精華地的重分配權。建商已在沿線屯地，南鐵東移亦成為建商炒房題材。賴清德甚至藉由南鐵東移案賤賣照顧宅市地給他的金主。
五、2013年8月民進黨主席蘇貞昌完全蔑視、逃避居民陳情。其隨扈甚至將南鐵青年壓制在地。蘇貞昌撂下「民進黨不需要你們這些選票」後，揚長而去。
六、2014年蔡英文任民進黨主席後，居民屢次要求向蔡英文說明南鐵案的真相，但屢遭拒絕敷衍至今。2015年6月於台中人權會造勢餐會中，南鐵代表向蔡英文請問「取得政權後，是否支持南鐵聽證會」，但遭虛應敷衍。
