馬習會結束已逾半個月，各界關注兩岸是否在關係發展上採取更進一步具體行動，包括討論和平協議。馬英九總統24日在與媒體餐敘時表示，我們並沒有說永遠不談和平協議，「馬習會就是另一種形式的和平協議」，在這種情況下，要不要在現階段簽和平協議，確實不是我們目前考慮的重點。
馬英九率行政院長毛治國及相關首長南下中台灣，進行兩天一夜的節能減碳之旅，晚間並利用與媒體餐敘場合，回應兩岸關係及赴太平島視察等議題。
對於在中美因南海議題出現齟齬之際，傳出馬英九可能於12月親赴太平島宣示主權，馬英九並未透露任何口風，僅表示太平島是中華民國的國土，從來沒有排除過登島的可能，但未定案之前不會對外表示意見。
主權在我是我們對南海的一貫主張
至於對南海爭議的立場，馬英九說，今年5月26日宣佈南海和平倡議時就說就很清楚，我們對南海的主張一貫是主權在我、擱置爭議、和平互惠、共同開發，這立場沒有改變。
對於台灣與菲律賓在本月初簽署《漁業執法協議》，南海和平倡議獲致具體成果，台海是否也可能出現建構台海和平架構的具體協議？馬英九表示，對於台海、東海、南海等「三海」，我方一向主張以和平方式解決爭端，例如南海最近簽署《台菲漁業執法協議》，東海則有《台日漁業協議》，涉及劃分漁區議題。
在與中國大陸方面，馬英九說，兩岸簽署23個協議，都是廣義的和平協議，因為沒有和平就不可能簽這些協議。馬英九強調，我們也沒有說永遠不談和平協議，但依目前所進行的程度，他和中國國家主席習近平都已經碰面，「馬習會就是另一種形式的和平協議」；在這種情況下，是不是還要在這個階段簽和平協議，確實不是我們目前考慮的重點。
馬英九同時表示，以目前情況來看，兩岸若把貨貿協議、互設辦事機構，及陸客中轉等這些議題談成，對台灣民眾帶來的好處將會超過簽一個單一的和平協議。
習先生若關心 互設辦事處機會大
至於兩岸互設辦事機構的進展，馬英九說，他在馬習會的正式會談中就提出此一議題，在互設辦事機構的協商過程中，剛開始的問題是我方希望爭取探視台籍受刑人，卻被誤會為外交上的領事權，問題已獲得澄清；後來台灣發生學運，對岸又擔心派駐人員的安全，因此我方也向對方說明，台灣是很安全的社會。
馬英九表示，互設辦事機構的問題還在努力解決，若能談成，對雙方都是好事；一方面有派駐人員之後，服務的機會和品質都會提升，對雙邊關係也會有所提升。至於能否在任內完成，馬英九說，會朝那個方向努力，「如果習先生關心的話，成功的機會比較大」。
