新政府未來上路後，政府部會是否考慮遷出、不要全都集中在台北市？台中市長林佳龍向總統當選人蔡英文喊話，希望立法院能遷到台中；台南市長賴清德也表示，可以把總統府及文化部遷到台南。
林佳龍表示，目前立法院是向台北市政府租借，必須付租金，多年前已有遷建的聲浪；從國家安全的角度來看，中央組織也不應該全都集中在台北市。他認為，台中市地理適中，也是過去省議會所在地，他將全力爭取立法院遷建台中。
賴清德則建議，把總統府設在台南，因為國民黨長期重北輕南，把總統府、部會南遷，可以帶動各地均衡發展，這也是他擔任立委以來的主張。同時，台南也是「文化首都」，可以考慮把文化部搬來這裡；至於目前沒有專屬廳舍的勞動部，可以設在有眾多勞工的高雄市。
