蔡英文當選總統後，台灣民進黨各派系都臣服在「英派」之下，唯有前副總統呂秀蓮堅持做自己，不被「收編」。
針對兩岸僵持不下的「九二共識」，她承認當年確實有此共識，蔡英文沒有必要否認，但九二年之後，前總統李登輝和陳水扁分別提出「兩國論」以及「終止國統會」運作後，九二共識形同廢止，而且情勢變遷，蔡英文代表台灣最新民意，大陸沒理由要她接受二十四年前舊政府的決議。呂相信，有理走遍天下，「應該和習近平先生好好商量」，放眼未來，一起研究出新的共識。
呂秀蓮過去經常批評蔡英文，被黨內形容有「呂蔡心結」，最近一次是針對蔡有意從黨外找副手有所不滿。她說，這是「對不起民進黨」，她絕對會反對到底。雖然如此，一月十六日蔡英文勝選之夜，呂還是被請到台上，笑咪咪地站在蔡身旁，接受民眾歡呼。
呂蔡同為民進黨卓越女性，一個做過副總統，一個新當選總統，但彼此並不熟識。對於蔡過去的某些作為，她略帶酸氣表示，蔡「不是正統的民進黨，所以她副總統根本不管你民進黨，她要用誰就用誰！」同時她也對前年台北市長選舉，蔡決定禮讓柯文哲，頗有微詞，當時她也投入台北市長選舉。不過她也承認，蔡絕非簡單的人物，「整個民進黨因為她而改變很多，改變到底好或壞，要時間驗證」。以下是呂秀蓮接受亞洲週刊訪問的摘要整理：
蔡英文提出中華民國憲政體制的概念要跟大陸對話，用這個來取代九二共識，你認為對岸可能接受嗎？
台灣如果沒有任何價值、沒有任何條件的話，當然北京會予取予求，如果作為台灣的領導人，可以展現台灣的價值，這價值分兩種，一種是台灣人的基本價值，我們是一個有尊嚴、有主權的國家的國民。另外一個價值是台灣本身的戰略價值，當中美兩國在亞洲互爭領導權的時候，台灣的戰略價值是不容忽視的，這個時候雙方就要對等、尊重，你的主張、我的主張、什麼是合情合理的，我覺得這很重要，作為台灣的領導人，當然要強調台灣的價值在哪裏，所以九二共識是一個可以辯論的議題。我不會去否認九二共識有沒有的問題，因為一九九二年香港談判，後來李登輝領導的政府引用了一九九二年八月一日總統府國統會通過的「八一決議文」，決議文講海峽兩岸都主張一個中國的原則，台灣跟大陸都是中國的一部分，這個決議文傳真給北京，北京當然很高興，所以就同意了，但重點是當時會通過「八一決議文」的環境跟二零一六已經不一樣了，一月十六日選出的台灣領導人應該說她代表的是最新的民意，這群選民跟一九九二年不一樣，當時的選民據估計過世的約有四百萬人，二十四年來新增六百萬選民，所以有一千萬人的民意不同，沒有理由強迫我去代表二十四年前的民意，這中間又有很多變化，九六年台灣首次總統直選，九九年李登輝宣布台灣跟中國是特殊的國與國關係（兩國論），就李登輝本身來講，當時他還有權力，表示他已經否定「八一決議文」，接下來二零零六年二月二十七日，陳水扁總統也宣布「國統會終止運作、國統綱領終止實施」，所以一九九二年所發生的事情，沒有理由後任的總統要一輩子遵守，我覺得就很坦承的告訴全世界，台灣的民主是這樣走過來的。
