2001年古茲曼賄賂獄警，躲藏在運送洗衣物的貨車中，順利逃獄。2014年他行蹤曝光再度被逮，被關進墨西哥戒備最嚴密的「高原聯邦監獄」（Altiplano Prison），但「道高一尺，魔高一丈」，他花了1年時間在牢房底下挖掘1.5公里的地道，第二度越獄成功。古茲曼最後於2016年1月在墨西哥北部被逮捕，潘尼亞涅托還親自向全國宣布這項消息。
「老朋友，這就是結局了」昔日犯罪拍檔在法庭相見
目前有約12名古茲曼的手下向美國檢察官招供，來自哥倫比亞的西富恩特斯是其中一名，他們的證詞讓外界得以深入了解，神秘又惡名昭彰的「錫納羅亞販毒集團」如何犯下賄賂、跨境販毒、洗錢、襲擊政府部隊等多重罪狀，例如管理古柯鹼買賣的負責人曾經整形改變容貌，20幾歲的資訊專家曾幫古茲曼建立加密手機系統，但認罪後又與聯邦調查局（FBI）合作駭入手機。
除了前總統潘尼亞涅托以外，另有一名手下供稱，曾在2005年支付數百萬美元給現任墨西哥總統羅培茲．歐布拉多爾（Andres Manuel Lopez Obrador）的幕僚，但並未透露幕僚姓名。不過隨後首都墨西哥市（Mexico City）前官員雷吉諾（Gabriel Regino）在推特（Twitter）上喊冤，收賄指控完全不實。
根據《紐約時報》（NYT）報導，西富恩特斯2007年與古茲曼結緣，當時古茲曼與一群手下躲匿在美國加州的深山裡，那之後的6年間，他們倆變成為非作歹的好拍檔，管理毒品交易、購買武器、處置敵人，2013年西富恩特斯遭逮捕後與古茲曼斷絕聯繫，在決定後半生的審判上，他選擇背叛古茲曼。時隔多年在法庭上見面時，西富恩特斯嚴肅地朝著古茲曼點了點頭，像是在說：「老朋友，這就是結局了。」而古茲曼也對他頷首示意。
Alex Cifuentes Villa, El Chapo’s former assistant, would end up accusing a Mexican president of taking bribes at his former boss’s drug trial https://t.co/AYowlwHRVf
— The New York Times (@nytimes) 2019年1月17日古茲曼（左）與西富恩特斯（中）的合照
