整合體成員國貝里斯與哥斯達黎加拒絕參加，台灣是該組織區域外觀察員。
值得注意的是，中美洲議會在馬英九抵達前換上的通告中，以「中國台灣總統」稱呼這位罕見的元首級嘉賓。稍早前該網頁上僅顯示馬英九出席特別會議排定的發言時程，沒有任何歡迎字眼。（編案：中華民國外交部16日表示並無此事）
由於中美洲議會成立章程中賦予會員國卸任正副總統2人「當然議員」資格，享受與各國選出正副各20名議員免於起訴的特殊豁免權，成立近四分之一世紀以來飽受各界批評。
2002至2006年宏都拉斯總統里卡多．馬杜羅（Ricardo Maduro）任內，中美洲議會議員利用免檢車輛越界運送毒品，議會內更被抄出毒品交易。馬杜羅批評該無實際效力的區域議會是毫無功能的「大白象」，一度建議退出。
有鑒於巴拿馬三位卸任總統藉該豁免權逃避貪污腐敗刑責，2009年7月1日，里卡多·馬丁內利總統（Ricardo Martinelli）就職後宣佈履行競選承諾，強調卸任後不會接受該特權，更宣佈退出該「賊窩」（cueva de ladrones）。
巴拿馬國會於當年12月11日同意退出該區域議會，但巴拿馬高院於2012年1月判決該舉措違憲，下令重返中美洲議會。
馬丁內利本人也因身涉多宗包括竊聽及濫用公款等重大貪腐案件，在2014年7月1日卸任當日交接前搭機前往危地馬拉，宣誓成為中美洲議會議員，並要求議會對其繼任者巴雷拉的「政治迫害」給予庇護。
馬丁內利逃往美國邁阿密，目前正面臨引渡返國受審的司法程序。
薩爾瓦多卸任總統富內斯（Mauricio Funes）2014年6月1日卸任後，主動前往中美洲議會宣誓出任議員。該國國會拒絕承認其資格並移送高院裁決，同時對其來源不明財產立案調查。
中瓜瓜葛
莫拉萊斯聲稱與中國僅發展經貿往來，無意開展外交關係。但據BBC中文網了解，2007年哥斯達黎加首開中美洲國家與台北斷交轉而承認北京先例以來，瓜地馬拉歷屆政府持續建議北京採取1997香港回歸前與巴拿馬、多米尼加及海地互設具有大使館功能商務辦事處模式，與瓜地馬拉互設商辦處，但遭到北京的拒絕。
2010年5月，瓜地馬拉總統科洛姆（Alvaro Colom）主持中資中機新能源（CMNC）承包瓜地馬拉捷豹能源（Jaguar Energy Guatemala）300兆瓦固體燃料發電廠工程開工儀式，三年後因資金未到位而陷入停滯。
2015年5月，滯留發電廠的中國工程師與技術人員在等待捷豹能源付款未果，發生遭捷豹能源警衛開槍驅離工地，多人輕重傷事件。
一位不具名的中國外交人員說，類似的案例凸顯出中美洲國家不講誠信的作為，看不出與這些國家開展關係的前景。（責編：葉靖斯）
