二、祭祀
迎來先賢先儒的神靈後，先是進饌。秉持孔子「食不厭精、燴不厭細」的精神，祭孔大典中共備有「三羹、四食、十籩、十豆」等27種菜色，並依等級依序遞減為「八籩、八豆」及「四籩、四豆」，各殿宇加起來共有189道饌品。
緊接著為三獻禮，由正獻官與分獻官到各神位前獻帛、獻爵及獻酒。三獻禮後為總統上香及奉祀官上香。
值得一提的是祭祀程序中「飲福受胙」。「飲福」，係指祭祀完畢喝供神的酒；「胙」就是我們一般說的帶皮、脂肪及肉的三層豬肉。由於古代祭祀者向神明祈禱賜福，神明會將福澤賜於祭品中，祭祀完畢後由參與祭祀者分享祭品、肉或酒，藉此得到神明的祝福。三層豬肉過去多由正獻官帶回去。
由於過去拜拜的豬肉都是整隻宰殺後帶毛皮的豬、牛、羊，祭祀後地上多會留下些豬、牛、羊的毛，也就是一般所稱的「智慧毛」。民眾相信，拿到「智慧毛」者會可以長智慧、考運佳，常造成民眾爭搶。然由於近年環保意識抬頭，這些祭品改以糯米粉所做的素食豬、牛、羊，祭祀後不僅可讓正獻官帶回去，也會分送現場民眾。
為什麼要祭孔？
1.強調政權的正統
「孔子作春秋而亂臣賊子懼」，春秋之筆所留下的歷史記載往往是許多當權者所忌憚，因此歷代皇帝為了強調統治政權的正統性，都會以大祀規格來祭拜孔子。
2.馬上得天下，不能馬上治天下
漢朝的陸賈曾以一句「馬上得天下，卻不能馬上治天上」來勸諫剛得到政權的漢高祖劉邦，讓儒家仁義禮治思想獲得劉邦的重視，更以天子的規格來祭祀孔子。
陳彩虹指出，而歷代帝王中最常到山東曲阜祭拜孔子，以清朝乾隆皇帝去8次，排名第一，這也看得出以「馬上得天下」的清朝皇帝對於儒家思想的重視。
3.台灣承繼兩千多年來的中華文化
自國民政府播遷來台後，即開始恢復祭孔。同時由於中國大陸在1950年代開始推動三反、五反、大躍進以及文化革命等大規模群眾運動；1966年發動文化大革命，使得許多中國文化遺產遭到破壞。
為了強調台灣承繼中華文化兩千多年來的道統，先總統蔣公更於民國57年（1968年）下令組成「祭孔禮樂工作委員會」，全面研究祭孔的儀典與制度，可以說是完整保存這項文化。
儒家思想在台灣受到保存，也影響到鄰近的日本、韓國、越南等地，每年都會有許多日本、韓國的學術團體，都會來到台北孔廟來觀摩台北孔廟的釋奠典禮。
台灣各地承襲不同朝代的制度
台南孔廟是全台第一個設立的孔廟，台北孔廟則是全台唯一由民間捐資成立，再捐給政府經營，並於民國59年（1970年）被指定為祭孔釋奠典禮的示範地點。
