台灣不少學校近年來都開始進行整併，以妥善投入資源、培育人才。陽明交通大學與清華大學近期更分別邀請新竹女中及新竹高中成為附屬高中，其中，新竹女中已在6月30日校務會議同意改隸，教育部也表示尊重學校合併規劃。不過，有多位竹女校友發起連署拒絕併校，更指新竹各所高中需要的是「資源均質化」，而非獨厚明星學校。
陽明交通大學為培養更多女性STEM（科學、科技、工程、數學）人才，近來邀請新竹女中成為附屬高中，希望2校合作成立國際菁英、科學家、生醫等學程，以銜接大學部國外雙聯學位，目前已與竹女啟動「新竹女中改隸陽明交大附設中學」工作小組研擬相關計畫。
對此，新竹市議員廖子齊在臉書表示：「望母校三思！」廖子齊、主婦聯盟生活消費合作社理事主席彭桂枝、藍盾永續文化有限公司代表林秀叡、兒科醫師張淳翔，以及近年剛從輝瑞公司退休的旅美化學博士趙致敦等多位竹女校友，以「積極開創・促進合作，拒絕併校」為口號發起連署反對併校。另外，前民進黨發言人李妍慧也質疑：「這些校際的合作，一定要改隸於下才能達成嗎？」
竹女校友們認為，產學合作交流有許多方式，加上國教署已挹注資源支援教學、鼓勵大學及高中合作，因此培育女性STEM人才不一定要透過併校、改隸，且竹女若要加強學生對STEM等各科領域的興趣及深入了解，也不應只和1所科系有限的大學合作；此外，竹女作為明星高中、百年老校，其實都已經有連結所謂頂大的教學資源，新竹各所高中需要的是「資源均質化」，大學可以選擇提攜社區高中，而非獨厚明星學校。
連署書也提及，雖然現代教育環境提倡培養STEM理工人才，但不代表其他學科不重要，讓學生在各學科均衡學習發展，才是高中教育的意義。再者，竹女改隸後將增添上級單位，恐影響原本的校務運作及決策，竹女應維持自主性、保持與各校合作的開放性；另外，校方面對併校議案，應先行於校內納入學生代表、家長會代表及校友代表，成立工作小組進行討論。
