經過1個多月的戰鬥，國民黨的軍隊反攻成功，重新占領了東北的戰略要地四平街，並進入長春。同時在馬歇爾鍥而不捨之下，六月時國共再次達成停火協議，並展開談判；然而，一直到停火期限結束時，雙方仍未達成協議，因此雙方的衝突並未停止。
1947年共軍逆襲，從此國民黨節節敗退，輸到剩台灣
之後，國民黨在推動國民大會的同時，在戰場上也掌握了較多的優勢，不但順利拿下張家口以及共產黨在熱河的最後據點 – 赤峰，1947年3月，國民黨還拿下了共產黨長年以來的根據地 – 延安。
可惜好景不長，1947年開始，國民黨在共產黨的「鄉村包圍城市」、游擊戰騷擾，以及推動土地改革來攏絡人心之下開始節節敗退，同時中共軍隊也拋棄國軍番號，陸續改稱為中國人民解放軍（簡稱解放軍）。1948年9月到1949年年初，三大戰役（即遼瀋戰役、徐蚌會戰、平津戰役）的失利，國軍總兵力損失高達百萬人，精銳軍團盡失。「遼瀋戰役」結束後，不僅宣告國民黨東北全面淪陷，更是預告了國民黨軍隊將在往後的國共內戰中一敗塗地的窘境。
之後的1948年11月「徐蚌會戰」也在解放軍的游擊戰騷擾之下，兵敗如山倒。而在徐蚌會戰後期，為避免國民黨將華北部隊投入會戰，共軍在華北也發動了「平津會戰」，牽制了華北的國民黨軍隊。
面對不斷失利的戰局，在國民黨內部的壓力下，蔣介石在1947年1月21日宣布下野，由副總統李宗仁代行職權。沒過多久，華北地區剿匪總司令傅作義和共軍達成「和平解放北平」的協議，這意味著華北也淪陷了。從1948年9月到1949年1月，國民黨兵敗如山倒，不僅失去東北及華北的統治，也失去了大量的精銳部隊。
上任的李宗仁雖然試圖和毛澤東展開和談，但是過程不順利，最終宣告破局。和談失敗後，毛澤東下令共軍渡江，4月23日南京失守，接著華中各地一一淪陷。八月時，湖南、江西、福建也落入了共軍的手中。最後連美國也放棄了，1949年8月，美國發布《中美關係白皮書》，該文件指出「中華民國在國共內戰的失敗應該歸咎於國民黨本身，與美國無關」。
中央只能從廣州遷往重慶、成都，最後在1949年12月離開了中國大陸，遷到孤懸海外的台灣並一直持續至今。只是當時他們是退守到台灣，還是非法占領台灣呢？
二戰後台灣何去何從？開羅宣言暗藏玄機
有人認為，台灣是被中華民國非法占領，但也有人認為，台灣就是中華民國。究竟哪個才是正確的，《中華民國斷交史》並沒有辦法去回答這個大哉問，不過能確定的是，「台灣」跟「中華民國」之間有一段斬不斷、理還亂的緣分。
