台灣去（2018）年通過反核食公投，恐引響我國加入由日本主導的「太平洋夥伴全面進步協定CPTPP）」。總統蔡英文在接受日本《產經新聞》專訪時表示，台灣是世界貿易組織（WTO）的會員國，會秉持WTO的精神，與日本政府溝通，找到雙方都能接受的方法「不要去衝擊了雙方了貿易跟雙方的友誼」。
針對日本福島周邊5個縣的食品解禁問題在去年公投中被否決，蔡英文在接受專訪時強調，會秉持WTO的精神，按照WTO的法規處理貿易事情，希望能跟日本政府好好的談出一些方案，但政府也必須遵從公投的結論，且它的效力是2年。
蔡英文說，台灣與日本觀光客來往頻繁且交通便利，希望日本觀光客能多到台灣觀光旅遊。另外，台灣人也很喜歡日本的農產品，如果可以加入CPTPP，相信日本農產品有更多機會進入台灣。蔡英文進一步表示，在美中貿易的衝擊下，如果台灣能夠加入，台灣與CPTPP的國家，尤其是日本，可以形成新的、更強而有力、且更有競爭力的供應鏈。
