針對教育部長吳思華22日向反黑箱課綱學生代表表示，若對課綱微調有意見，應該去問未來教育部長潘文忠。潘文忠23日發出新聞稿指出，吳思華可能不了解當時狀況，他擔任國家教育研究院副院長期間，雖然負責督導國教院課程研發業務，但因教育部作法與他個人理念不符，因此他被要求不再督導該業務，也未再參與後續研修過程。
針對課綱爭議，教育部長吳思華22日受訪時表示，課綱是否中止得看新部長的決定，微調課綱制訂時，潘文忠任國家教育研究院副院長，「都他在處理，我來（指接教長）時都已經定案了，不應該問我。」
潘文忠強調，他從擔任教育部國教司長以來，就一直希望建立國家課程研發機制。2008年，他任國教司長時，就補助經費給國教院籌備處進行課程基礎研究，就是希望建立一套公開透明且多元參與的課程發展機制。
潘文忠表示，他很遺憾教育部要求針對高中國文、社會課綱進行微調，卻不依研修程序進行，參與的成員也不具代表性，在這樣違反規範的情況下，與他個人一貫理念不符。同時，他也被要求不再督導課綱微調業務，也因此沒機會再參與後續的作業程序。
潘文忠呼籲吳思華，在深入了解高中國文及社會課綱微調缺乏程序正義及專業性之後，應即廢止課綱微調，讓教育回歸專業，也建立國家課程專業、透明、多元參與永續的發展機制。
