北京語文課改教材第13冊把《上帝創造宇宙》這篇基督教聖經內容定為神話故事列入教材引起網絡激烈辯論。批評者說，語文教材收錄聖經涉嫌違反了教育法關於「國家實行教育與宗教相分離」的規定，宗教進入教室違反了憲法。
一般認為教科書編寫涉及話語和價值體系，因此教科書經常成為不同政治價值和觀點爭奪的場所，諸如中國、韓國和日本之間對於教科書對二戰歷史描述的爭議。中國社會在過去30年經歷的經濟、社會和政治變化也不可避免地反映在教科書的變化中。
對於語文教材引用聖經故事，批評違法的觀點援引了1995年人大通過、國家主席發令執行的《中華人民共和國教育法》第八條規定：「教育活動必須符合國家和社會公共利益。國家實行教育與宗教相分離。任何組織和個人不得利用宗教進行妨礙國家教育制度的活動。」
不過為教材出版社辯護者認為，聖經入選語文課本並非因為其宗教性，而是因為它具有重要的文學價值。
不過反對者認為，世界文學史中有眾多神話，比如希臘和羅馬神話，北歐神話，為什麼要從基督教典籍裡面選呢？許多評論者認為，中小學教材，特別是語文教材有塑造思想價值觀的重要功能，當局選教材應該更慎重。
有網友評論認為：「義務教育是通識教育，不少人獲取這方面的知識只有課本，課本不講他們永遠不知道，既然是稀缺資源，肯定挑重要的……」
還有評論說，教材選定和出版自由是倆碼事，公眾可以自由閱讀，但是否應該在兒童的課本裡加入宗教內容就是另外一個問題。「我不希望我孩子在還沒有分辨能力的時候被這類文章洗腦。」
與時俱進
與此同時，批評者曆數語文教材選材問題，指責語文教材的變化反映出敵對和外來勢力試圖影響中國低齡教育，在中國教育和思想領域爭奪話語權。
有人說，今年在福建、廣東等地新修訂的語文版一年級和七年級教材中多達40%課文被替換。選自《水滸傳》經典課文《魯提轄拳打鎮關西》被替換，理由是故事有違現代法治觀念，但支持者說不應該刪除以鋤強扶弱為主題《水滸傳》故事。
另外許多人也不滿《南京大屠殺》的課文被美籍華裔作家張純如《南京大屠殺》一書的片段《死裡逃生》替代。
面對來自公眾的批評壓力，語文出版社決定保留《南京大屠殺》作為課文保留，張純如的《南京大屠殺》片段作為附文供學生比較閱讀。
魏巍的報告文學《誰是最可愛的人》也被替換。支持者認為，這篇關於「抗美援朝」戰爭的課文被撤出課本是明智之舉，一個時代有一個時代的道德觀。「當時代發展到今天，還繼續向青少年灌輸陳舊過時的『革命英雄主義』，這背後折射出來的似乎是教育領域的一種固步自封。」
