總統蔡英文七月二十二日午間結束「自由民主永續之旅」返抵國門，迎接她的不是外交突破的掌聲響起，而是晴天霹靂的政治危機。在總統出訪十二天裡，國安團隊每天日夜監控中國動態，嚴防老共從中作梗；沒想到總統甫下飛機，接獲第一則重大情資報告，竟是國安特勤後院失火，夾帶近萬條免稅菸闖關，而總統事前「毫無所悉」……。
私菸案會查成類國務機要費案？
媒體報導，二十二日當天在桃園機場的貴賓室裡，原國安局長彭勝竹突然接到調查局副局長林玲蘭當面告知，要查緝國安局利用總統專機禮遇之便走私香菸一事，彭勝竹當場臉色大變。
最為震驚、震怒的莫過於總統蔡英文，當日下午她旋即要求彭勝竹到府報告，但據傳，彭勝竹疑因對整起事件掌握不清，原本想「推」調查局長呂文忠去報告，遭總統拒見。
「總統一旦真的見了呂文忠，那豈不是成了『黃世銘案』翻版？」府方嚴正聲明總統第一時間嚴守住分際，並未涉入司法偵辦。
私菸案固然是司法案件，總統不能介入，但此案也是國安事件，屬於安全情資的一部分。調查局是否應該向上通報，也因此存在灰色地帶。
日前一位媒體記者即直白詢問蔡英文：「妳的任內特勤不斷出包，有人說國安局管不到特勤中心，特勤管不到侍衛室，如果他們之後不是運毒（指私菸），而是運炸彈，那妳的車豈不是被炸了？」此問題一出，蔡英文當場臉色一陣鐵青。
私菸案爆發後，蔡英文數度強調嚴查到底的決心。總統的政治宣示固然說得斬釘截鐵，後續的情勢發展卻非操之在己。
黨政人士即透露，檢調單位如果把歷年來總統出訪的免稅品購買紀錄全都查，「往前查個八次、十次出訪，你想想，歷任的總統府、國安會、外交部、國安局……會有多少人『中』，那不就變成特別費案了？」「後續就看檢察官要不要花這麼多人力這樣幹，以滿足大家對所謂『高官特權』的想像。」
這樣的疑慮不是沒有原因。在這次私菸案的偵辦中，來自國安或檢調系統各種放話不斷，包括爆料者將黨政高官購買一般免稅品的金額，自行換算成等值菸品數量，意圖混淆為購買超額私菸，讓府院疲於奔命，澄清不完。
案外案！彭與葉早有不合？
私菸案爆發後，國安局長彭勝竹請辭獲准，總統府侍衛長張捷遭到調職，特勤中心七將校全遭記大過處分。後續政治效應持續發酵，除了總統府秘書長陳菊被國民黨立委要求負起政治責任，私菸案爆料立委黃國昌也數度點名國安會秘書長李大維：「國安局是你督導的，不要躲起來，不要裝聾作啞，請你出面說明！」「這像國安會秘書長應該有的擔當嗎？」
「老藍男」李大維向來是「老綠男」眼中釘，黃國昌這次窮追李大維責任，不少獨派或台派人士趁機「打蛇隨棍上」，樂見李趕快下台。
