長榮航空於梅姬颱風嚴重影響台灣期間，要求機師進行降落，被網友譏諷是「史上最狂」，連日來風波越演越烈，民航局也表示將介入調查，終於迫使原本揚言要控告料網友的長榮航空道歉。董事長林寶水9月30日發出內部公開信，先感謝出勤員工，並承認防颱作業的安排和處理不夠周延，公司將徹底檢討。
上月27日梅姬颱風暴風圈籠罩台灣，國際國內線航班大亂，各國航空均宣布停飛，唯獨長榮航空10多架飛機仍在台灣上空盤旋，伺機降落，引來外界「硬飛」的質疑，長榮雖強調起降符合程序，未來則會針對颱風期間天候評估及航班調度安排重新檢討，但仍無法平息輿論批評。
林寶水30日在公司內部發出公開信，表示每次颱風來襲，公司對於所蒐集的各項資訊，藉由專業部門判斷、分析，經多次開會討論，雖然訂出一個合乎安全標準的航機派遣規範，但因天候狀況瞬息萬變，導致梅姬颱風期間公司航班的起降，受到社會各界的關心，顯然防颱作業最終的安排和處理上仍不夠周延，這是公司必須徹底檢討並改進的地方。
林寶水說，對於來自民眾、媒體、專業機構及內部同仁建議、批評、關心或心聲，公司必會虛心檢討並重視大家的意見。未來，公司在面對天災的因應，除了安全以外，必會以更多餘裕、更大的思考面向、更謹慎的態度，提供安全、安心、信任、舒適為前提的作業規範。
民航局表示，27日長榮原訂返回桃機降落的航班有45航班，實際降落桃機有30個航班。另外有7架航機轉降香港，7架轉降台中，1架轉降澳門。民航局要求長榮提出說明，將對其航機起降標準、油量及組員飛時等，逐一查證是否合乎規定，若查有違規情形，可依民航法懲處60萬元到300萬元。
