選舉期間，葛特曼等人指控柯文哲仲介國人到中國進行器官移植，及他所進行的無心跳器捐有無違反醫學倫理，柯文哲明確地說：「我沒有仲介器官。」但「中國大陸會用葉克膜（ＥＣＭＯ）都是我教的。」
這起爭議，監委張武修與高涌誠經一年調查，日前提出調查報告，認為一九八七年實施《人體器官移植條例》後，衛福部未啟動腦死及無心跳器捐相關規範、配套措施，未能建立專業團體共識，有檢討改進的必要。
被指控仲介器官，柯文哲曾氣到提告。（柯承惠攝）
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