他在2011年及2014年的著作《政治秩序的起源：從史前到法國大革命》(The Origins of Political Order)以及《政治秩序的起源：從工業革命到民主全球化的政治秩序與政治衰敗》（ Political Order and Political Decay: From the Industrial Revolution to the Globalization of Democracy），綜合人類學、社會生物學、演化心理學、經濟學、政治學與國際關係等跨學科研究方法，分析了全球政治發展史，檢討成功發展政治秩序的因素，分析為何導致政治衰敗。
2015年福山在接受《紐約時報》（The New York Times）專訪時指出，他在撰寫《歷史的終結》時並未仔細考慮過政治衰敗，「我一開始沒有就國家能力這一問題給予足夠的重視」，經過多年，他更清楚意識到許多製度發展非常偶然且出乎意料。
福山談中國：有限法治、缺乏民主，是中國目前的問題
福山在《政治秩序的起源：從工業革命到民主全球化的政治秩序與政治衰敗》一書中，指出美國政體的諸多弊端，警示了「政治衰敗」的風險，相較於1989年對民主自由體制的信心，福山在2014年出版的著作中指出，國力和繁榮是政治體制是否成功的重要因素。此時國際上正巧有個非民主、憑藉經濟實力快速崛起的強國—中國。
對此，福山解釋，他的學說並不是要推崇中國，而是在強調國家能力與民主、法治必須達成平衡。他說，國家是一個權力的壟斷，就是國家合法地產生，利用權力來執行法律，保護國民免遭來自國內外的暴力，提供公共產品和服務包括教育、健康、基礎設施等。
法治，最重要的就是建立一套透明的製度，適用於整個政治系統中最有權力的人，換言之，如果總統或總理可以隨意改變這個制度，那就不能被稱為法治，因此法治從根本上說，就是對權力的限制。
最後，則是民主問責，世界各國通常是透過自由和公正的多黨選舉程序來定義民主，這些程序的重點，就是保證政府真正反映所有人民的利益，而不只反映統治精英階層自身的利益。這三者不能只是具有其中之一。而中國現在的狀況則是，具備強大的國家能力，但僅有有限的法治、缺乏民主，就可能產生「昏君」、「暴君」，這也是目前中國面臨最大的問題。
