海軍2020年敦睦艦隊遠航任務發生防疫疏失，引起全民關注、究責，國防部高級長官為此鞠躬道歉，蔡總統致歉意，國防部開始召開記者會說明；有論者將此事與「洪仲丘案」比較，令人怵目驚心，因事關國之干城、國家生存，其因應若有不慎，淺則被敵友看破手腳，深則恐動搖國本。
對臺灣生存言，國軍戰備訓練與防疫兩者是主與從、戰略與技術、常與變的關係；不論有無疫情，中共都在以複合式作戰推進「統一」進程、威脅臺灣生存，且步步進逼，不達目的不會終止，而疫情雖烈，但終會過去，至多形成「新常態」；臺灣海峽是東南亞、東北亞間關鍵戰略性水道，是防遏中共勢力擴張的第一島鏈中心，是兵家必爭之地；敦睦艦隊任務是我國海軍年度的綜合性、全方位訓練，涉及軍事、國防戰略、國家戰略甚至同盟戰略，是軍、經、政、外交基本功、蹲馬步的總驗收，在我國際交往遭中共打壓封鎖環境下，更是難得的呼吸管之一；故敦睦艦隊的防疫疏失，應先站在臺灣生存的角度來思考:海軍、國軍的建軍備戰、全民國防、居安思危是根本，無論有無疫情，都不可一刻鬆懈；防疫疏失檢討要就事論事、追求實效，做到亡羊補牢，因禍得福，切忌無限上綱，動輒論政治責任，乃至打垮國軍士氣。7年前的「洪案」幾使軍已不軍，國軍根本難再經浪擲。
要亡羊補牢、因禍得福，必須以戰略溝通立場來因應。國軍高層既已道歉，海軍防疫疏失的檢討，就要做到總統指示的「誠實以對」，按軍紀、軍規，釐清具體防疫的技術性缺點，再據以列出責任人員名單，提出補救之道，有階段性結論後再向全民報告，國軍要用德國總理梅克爾式的冷靜、精準，帶動社會、全民的心平氣和，最重要的是存誠務實，就事論事，國軍4月23日召開相關記者會，就是很好的開端。
具體來說，我國軍醫能量應要審視。軍醫系統「軍陣醫學」專業受重視程度恐需加強，軍陣醫學即戰場急救後送、創傷復健、運動醫學、感染公衛、壓力心理緩解，其中就包括防疫；國軍各級軍醫院確有戰時傷患救治病床等能量統計，軍醫局長曾於2015年6月赴國軍高雄總醫院視導軍陣醫學與防疫準備，國防醫學院衛勤訓練中心培育國軍各級急救技術員，2019年在民間舉辦過軍陣醫學體驗營，但似乎缺乏有臨場感的實際演練；此次國防部檢討中4項缺失中「任務前防疫措施規劃不足」即已指出核心。
其次，可精進敦睦艦隊任務的執行能量。敦睦艦隊遠航屬軍艦外交，自1953年迄今舉辦50餘次，由於任務性質全面、複雜，都由一時之選的海軍將領擔任支隊長，如當時的劉和謙少將、顧崇廉少將、莊銘耀少將、李傑少將、林鎮夷少將、高廣圻少將、陳永康少將、劉志斌少將、梅家樹少將等，選狀況最好的軍艦，由支隊長親自挑選骨幹幹部，組建而成；造訪國家多者5國少則1國，歷年有菲律賓、關島、夏威夷、沙烏地、南韓、南非、新加坡、巴拿馬、瓜地馬拉、帛琉、諾魯等國；航行到公海狀況萬變，包括遭遇中共艦艇，天候不良，艦艇故障等，都是指揮官及整個團隊的實地考驗；海軍官校學生在學期間習得的航海、輪機、作戰專業，在敦睦行程中得到一次綜合實地觀摩、演練，艦上官兵亦得到跨國境、遠洋航行機會，累積航海時數，實際操作海上加油整補等平時不容易訓練的困難課目；行前赴訪國的港口補給，各國高層、行程安排的事先協調，則是後勤、外交部門大展身手的機會；敦睦已形成海軍、外交部培養未來幹部的搖籃。此次出現防疫疏失，顯示事前規劃、執行未能納入最新的疫情因素，如啟航前未能發現可能有無症狀染疫者，返港後檢疫未臻確實等，應視為逆增上緣、精益求精的契機，宜增修作業準則，加強平時演練。
