2016年國民黨敗選，當年WHA在民進黨籍總統蔡英文後任期間舉行，台灣直到最後一刻才收到邀請函，中國國務院台灣事務辦公室發言人馬曉光表示，中國對於台灣參加國際組織的立場一向明確，及必須在「一個中國」原則下，通過兩岸協商作出合情合理安排。對於2016年台灣邀請函上第一次被加注「一個中國原則」，台灣行政院大陸委員會回應，台灣連續7年順利以觀察員身分參與WHA，是在國人努力、及國際社會與中國各方支持下所達成。
為什麼未獲邀請？
蔡英文出任總統之後，兩岸關係明顯降溫（BBC中文網）
國台辦發言人安峰山日前在例行記者會上表示，由於民進黨政府拒絶承認「九二共識」，因此台灣參與國際會議的基礎不復存在。安峰山反駁台灣政府稱無法參加WHA對台灣人民健康造成影響的說法，稱台灣與WHO的資訊交流是暢通無阻的，一旦發生公衛事件，台灣能夠即時有效應對。安峰山說民進黨應該檢討：「為什麼過去8年台灣能夠參加WHA，而今年卻不行，而不是一味地去推卸責任、轉移焦點，誤導和欺騙台灣民眾。」
台灣還去做什麼？
立法院各黨團推派的WHA視導團20日下午前往萬國宮參觀。
衛福部長陳時中在啟程前往日內瓦前的記者會上表示，本次未收到邀請函，難免覺得悲傷憤怒，也要表達遺憾，向WHO表達台灣參與必要性，展現台灣的軟實力，表示將在合法情況下表達抗議。陳時中與「世衛行動團」在當地時間20日抵達。參觀萬國宮時，陳時中表示希望做好凖備，「明年一定要進來」。21日將與多個國家展開會談， 22日舉行國際記者會。陳時中對《路透》表示，台灣2300萬人民不能被排除在世界健康網絡之外。
