監察院長陳菊上任後，宣布成立監察院與司法院的「院際協商小組」，引發質疑是侵犯總統職權。為避免外界誤解，院際協商小組決定更名為「院際聯繫小組」，不過，民進黨前立委林濁水再度批評，難道換了名字，就不必擔心被質疑了嗎？
監察院日前指出，為使監察院及司法院院際協商機制發揮功效，會中決議由監委組成「院際協商小組」，就協商議題及兩院爭點，與司法院相關人員先行研議，並將獲致的相關意見提交院會討論，作為監察院共識。
但國民黨台北市議員羅智強指出，院際協商是總統職權，什麼時候變陳菊職權？批評陳菊擺明是想用政治力干預司法院的獨立審判，「說穿了，陳菊就是更大號的陳師孟，想把自己搞成司法太上皇，把監察院東廠制度化！」
林濁水也指出，雖然院際協商小組決定更名為「院際聯繫小組」，但先前協商小組會被質疑，就是因為「協商」約定俗成的意義是「喬事」，而現在換了名字，難道「就可以做本來想做的事，而不必擔心被質疑了嗎？」
林濁水表示，就因為監院擁有糾彈百官之權，所以就可以有喬事權，監督司法院之權嗎？林濁水也批評，「既然信誓旦旦支持廢院，為什麼要廢前，先行權力升級？」
