《路透》引述政府消息人士稱，台灣當局面臨艱難的境地，雖希望幫助合法或非法逃離的香港公民，但公開援助舉措必須相當謹慎，以防引起中國強烈反對，進一步使台海局勢升溫。民進黨立委洪申翰向《路透》說：「這就像解聯立方程式一樣，我們需要考慮到人權，也需要權衡兩岸之間的緊張關係。」
蔡英文總統確實承諾會協助來台港人，包括協助就業、給予生活津貼和輔導，但是那是在《港區國安法》出台前幾週說的話，當時台灣當局不知道這部惡法的內容和含義。在該法律的授權下，北京可以將其認定犯下「顛覆或分裂國家、恐怖主義或與外國勢力勾結」行為的任何人，處以無期徒刑。《路透》引述3位消息人士宣稱，台灣政府不希望被指控幫助中國當局通緝的「暴力罪犯」。
低調才是保護與救援的方法
目前台海局勢升高，美國衛生部長艾薩（Alex Azar）之後，美國國務次卿柯拉克（Keith Krach）訪台，中國對這兩次訪問皆作出強烈反應，頻繁派出軍機擾台，不僅越過台海中線，還進入東沙群島附近空域。中國官員曾向《路透》表示，由於任何政策失誤都可能導致軍事衝突，台灣與中國之間需要處理微妙局勢的外交手段，「我們從未談論開戰，但我們必須意識到這種危險。」
與此同時，在台灣本土，蔡政府面臨越來越大的輿論壓力，要求採取更多措施來幫助香港公民，例如，通過「難民法」或制定《港澳條例》18條規定施行細則，無論合法或非法入境的港人，政府都應給予協助。3名消息人士建議台灣政府進行非公開援助，「少說多做」，台灣確實迄今提供不少具體幫助，例如核准入境簽證，而此舉並未引起中國指責台灣與香港「分裂主義者」共謀。
其中一位消息人士說，關於走私的新聞報導「非常棘手，給我們帶來了很多麻煩。」他還說，中國施壓越來越強勁，但他並沒有詳細說明情況，僅稱「台灣政府將堅持不遣返的原則」，此外台灣正在「模糊」政府對香港公民「人道主義援助」的細節，以使公眾和媒體難以核實非法入境的報導，「如果要救人，我們就要盡可能保持安靜……低調是保護人員的唯一方法。」
中國施壓強勁，國台辦稱：台灣當局與獨派反中勢力「勾結」
中國與香港政府官員和官方媒體對台灣的抨擊與施壓毫不間斷。9月14日，香港前特首梁振英在臉書（Facebook）發文質問，為什麼台灣不提供有關東沙群島附近抓獲的5名港人下落。同一天，香港安全局呼籲台灣政府不要「窩藏罪犯」。
梁振英現在是中國全國政協副主席，他告訴《路透》，重要的是要了解這5人的身份，以確定「他們是逃犯還是逃離法庭審判」。他更稱，香港政府期許台灣當局告知，這5人被以什麼罪名扣押，是否會被釋放、起訴或驅逐出境，以及他們是否有法律救濟途徑。
