日本第三波新冠肺炎（武漢肺炎）疫情一發不可收拾，為了全日本2021年的重中之重—東京奧運—能順利揭幕，東京當局已向各大藥廠採購2.9億劑疫苗（每人需接種兩劑），足夠全國1.26億人口施打，務求趕在奧運會登場前完成「全民接種」。但《華盛頓郵報》報導，儘管日本政府亟盼透過疫苗遏止疫情、提振經濟，日本社會瀰漫著對疫苗的高度不信任，卻是橫亙在「全民接種疫苗」宏大目標前的最大阻礙。
全球最不信任疫苗的國家
英國醫學期刊《刺胳針》（Lancet）9月刊登的一項跨國研究顯示，日本民眾對疫苗安全性、有效性的信任度，在涵蓋全球149國的調查中名列倒數，與法國、蒙古並列為對疫苗安全最沒有信心的國家，僅約不到一成（8.9%）的受訪者「強烈同意」疫苗是安全的，也只有約14.7%受訪者強烈同意疫苗有效。
《華盛頓郵報》（Washington Post）強調，新冠疫苗逐漸在全球各地展開施打之際，如何克服民眾對疫苗的懷疑與不信任，是各國政府當前的最大挑戰，但不同於諸多歐美國家，日本並不存在「反疫苗」（anti-vax）勢力或陰謀論盛行的現象，而公眾對外國疫苗的審慎甚至是恐懼態度，必須追溯到戰後以來多次發生的疫苗安全事件。
日本人為何對外國疫苗沒信心？
二戰後美軍佔領日本時期，美方為了遏制流行病在貧窮、營養不良的日本民間蔓延，確立了強制接種疫苗制度，甚至大肆圍捕不願施打疫苗的民眾。雖然這套制度挽救了無數生命，卻也曾發生白喉疫苗施打失誤，使68名嬰孩夭折的事件。直到1993年，日本發生接種「麻疹腮腺炎德國麻疹混合疫苗」（MMR）引發腦膜炎的案例，厚生勞動省為此付出巨額賠償，因此在隔年提出修法，將兒童「強制」接種疫苗的法規改為「強烈建議」接種。
米ファイザー開発コロナワクチン きょうにも国内で承認申請へ #nhk_news https://t.co/6epZtC8HWv
— NHKニュース (@nhk_news) December 17, 2020
神戶大學醫學教授岩田健太郎表示，日本政府自此之後對施打疫苗的立場舉棋不定，雖然具備疫苗接種計畫，「但卻沒有推廣疫苗的好處」。
雖然日本的兒童疫苗接種率仍相當高，但在2013年，由於施打人類乳突病毒（HPV）疫苗後出現肌肉痠痛、睡眠障礙等副作用的爭議頻傳，當局宣布放棄對全國青少女施打人類乳突病毒（HPV）疫苗的政策，今年4月發表的一項研究顯示，HPV的接種率已從70%滑落至不到1%，導致超過5千例原可預防的子宮頸癌死亡病例。
而在一般情況下，日本擔憂藥物療效將依種族而異，通常不會對海外試驗結果照單全收，而是要求藥品、疫苗在國內進行試驗，但在2003年，當局批准類風溼性關節炎藥物來氟米特（Leflunomide）未經本土最終階段試驗就在日本上市。大阪大學免疫學名譽教授宮坂昌之指出，後來才發現該藥物在日本核准使用的劑量，對日本人而言太高了，導致至少22人罹患間質性肺炎（interstitial pneumonia）、9人因而死亡的悲劇，但西方國家幾乎沒有出現相似案例，也致使日本民眾對外國藥物卻步。
