薛月順指出，本批檔案特色之一在於詳細而生動的描述，例如擊斃涉案人員劉學坤一段，上呈國防部的報告便相當清晰記載過程：「我部隊據報後，即派第3營隊搜索遁匪足跡、前往緝捕，於下午4時與匪遭遇，該匪竟拔槍抗拒，因槍故障未能射發，該營戰士還槍回擊。按本局原曾下令『非遇射擊不准開槍』，且以擊傷四肢為限、不准命中要害，該戰士乃對該匪腿步瞄準，惟該匪發槍未響、心荒圖逃、身軀蹲伏，遂致頭步中彈、當場格斃……身上搜獲化名『林正義』身份證一枚、槍一枝、子彈6發、手銬一付，匪屍經抬至光明寺交前，匪犯已指認，確係匪黨『蕭指導員』，真名劉學坤。」
此外，檔案也清楚顯示，當時關於所有鹿窟事件的報告都要經過國防部總政治部審查、即當時蔣經國主責單位。檔案可見副主任張彝頂、胡偉克之批示，雖然蔣經國親自批示較少、大多只寫個「可」、「如擬」或是簽個名，然而一份該年1月23日的檔案，留下了較罕見的蔣經國詳細批示、指示鹿窟事件後續偵辦方向：「有許多實際問題，現在就應開始檢討：一、追查有無其他基地；二、如何防止同樣事情之發生（警察等方面格外重要）。」
至於出動兵力，據檔案研判，94團2300多人、96團第3營500多人，加上95團第一營第一連與師搜索連共兩連，估計鹿窟出動軍警特可能有3000多人。
日治「左翼青年」末路 檔案收錄第一手記載「台灣第一才子」呂赫若人生最後一段時光
本次史料彙編另一特色，係收錄「台灣第一才子」呂赫若生前最後一段時間。呂赫若係日治時期著名客家籍作家，具寫作、聲樂、戲劇等才華，1947年二二八事件見證國民黨血腥鎮壓台灣之後轉向社會主義、加入共產黨並主編地下黨刊物《光明報》，在1952年鹿窟事件後失蹤，許多口述歷史指出呂赫若是被毒蛇咬死，但在涉案共產黨員劉學坤記錄下的報告才得到更進一步證實。
台大歷史學系教授陳翠蓮點評，劉學坤記下的這份檔案非常難得、很珍貴，記下呂赫若遭毒蛇咬後撐了8天半的過程。陳翠蓮表示，呂赫若是在台灣文學史與音樂史上都有一席之地、有才華的人，最後為社會主義理想上山，被蛇咬死；雖然一些民間傳說認為呂赫若沒死、可能早已隱身到國外生活、這些傳言可能是基於對他的不捨與美好想像，但這份手稿已很清楚記錄他人生最後狀況──他等不到有效醫療、在極端痛苦中死亡。
陳翠蓮表示，呂赫若人生中的最後幾天仍時常以日文溝通，甚至被蛇咬的極端痛苦下還會不斷自省、認為自己曝露出「有產階級」的姿態，到快死了還覺得自己這樣不夠優雅；甚至，呂赫若到最後仍在等解放軍抵台，問身邊同志：「解放軍應該本月會來吧？」這顯示呂赫若對外在大環境情況變化理解有限，那時解放軍不可能來台灣，但手稿也可見，他還抱有這樣的希望。
