國民黨立法院黨團5日召開記者會質疑，衛福部疾管署、食藥署疫苗施打率分別達為105%及169%。中央流行疫情中心指揮官陳時中在5日下午的防疫記者者會親上火線說明，對於相關人員接種作業，是避免影響防疫業務正常運作。
陳時中表示，外界有提到說，不管是食藥署、疾管署也好，造冊人數超過編制內的人數，但實際上每個機關都不是只有編制內的人，編制外也有，都列在相關人員裡面。陳時中提到，食藥署也是，相關工作人員都是工作的夥伴，所以也列在造冊裡面。
中央流行疫情指揮中心也透過新聞稿表示，為維持防疫體系運作，相關防疫人員與醫護人員均列為新冠肺炎（武漢肺炎）公費疫苗接種的優先施打對象，包含第1類「維持醫療量能－醫事人員」及第2類「中央及地方政府防疫人員」，其中第2類對象為「維持防疫體系運作之中央及地方政府重要官員」、「衛生單位第一線防疫人員」以及「港埠執行邊境管制之海關檢查、證照查驗、人員檢疫及動植物檢疫、安全檢查及航空安全等第一線工作人員」等。
指揮中心：相關人員接種以避免影響防疫業務正常運作
指揮中心指出，疾管署為新冠肺炎的防疫主責機關，負責疫情監控、邊境檢疫、社區防疫、感染管制及病毒檢驗事項等相關業務，該署造冊1261人，其對象除了編制內人員，正式職員、聘僱人員、工級人員為850人外，尚有研發替代役、臨時人員、駐點及承攬人員等411人，該等人員負責協助支援各項業務推動，包含協勤保全人員、資訊委外駐點等，協助邊境檢疫作業及檢疫、隔離與預防接種等系統管理維運，均擔負重要職責，亦屬指揮中心公布的第1類「維持醫療量能－醫事人員」及第2類「維持防疫量能－中央及地方政府防疫人員」。
指揮中心強調，因應新冠肺炎疫情，為維持防疫量能，又將防疫視同作戰，故以防疫業務推動與確保同仁防護能力為首要，進行相關人員接種作業，以避免影響防疫業務的正常運作。
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